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所謂農業防治就是利用生產中的各項GAP優質高產栽培管理技術來控制病蟲害的發生，這是防治病蟲害的基礎措施。這類防治措施不需要單獨的投資，結合栽培管理措施，既能提高藥材的產量和質量，又能控制病蟲害，從長遠看這是最根本的防治措施。但並不是所有的農業技術措施都有防治病蟲害的作用，有的農業技術措施還可能促使病蟲害的發生。當進行藥田管理時，應當考慮每種管理措施可能對病蟲害發生的影響。因此，選擇合理的耕作制度即能充分利用地力，控制病蟲害的發生，從而提高中藥的產量和質量。
一、輪作
輪作可以防治土壤、病株殘體等傳播的病害，如紅花枯萎病、茄綿疫病、羅漢果根結線蟲病等。對這類病害輪作田病輕，連作田病重。故輪作可以減輕土傳病害的發生，使病害保持在一個較低的水平。
輪作對於土壤傳播和田間病株殘體傳播的病害有較好的防病效果。對於能在土壤中腐生的病菌的防病效果較差。
輪作年限的長短，一般根據病原物在土壤中或田間存活時間的長短來定。如洋地黃、菊花枯萎病田的輪作年限一般為3～4a，川芎菌核病田輪作1a即可。輪作並不能把病害完全清除，只能減輕病害的發生。所以輪作要與其他防治措施配合，則可提高其防病效果。如配合清除田間病殘體，及時翻耕土壤，不施帶病菌的糞肥等，則輪作的防病效果更好。
二、整地
整地耙地、深翻土地可以減少在土壤中越冬的病蟲。土地整平可以預防田間積水，防止流水傳播病害和誘發病害發生。
土地深耕可將地面的病株殘體和病蟲翻入土中，加速病株殘體分解，能減少越冬病蟲。有些病菌翻入土中後不能出土而死亡，有些害蟲翻到地面，加速其死亡。深耕還可以改變土壤的理化性狀。多施有機肥，不要偏施氮肥，增施磷、鉀肥，可以改善土壤肥力，提高藥材的抗病能力。施足底肥，巧施追肥，不施帶有病菌的土雜肥。
三、改良土壤
土壤的結構、理化性質、肥力等對病蟲害的發生都有一定的影響。如十字花科藥材根腫病多發生在偏酸性的土壤中，在偏鹼性的土壤中很少發生。螻蛄多發生沙質土中，不喜歡粘土。丹參根結線蟲病多發生在通氣良好的土壤。氮肥偏多的土壤易誘發藿香褐紋病和綿疫病發生。土壤潮濕易誘發各種中藥疫病；土壤乾旱則促使黨參病毒病和首烏花葉病發生等。根據病蟲害發生的條件，及時改良土壤，也可減輕病蟲害的發生。
四、選好苗床和土壤消毒
最好選沒有種過藥材的地做苗床，而且土壤要肥沃，便於管理，可以防止土壤和糞肥傳播的病害。苗床要選在地勢高，便於排灌的地方。床土要肥沃，糞肥要充分腐熟。播種要均勻，不宜過密。播種後覆土也不要太厚，以利出苗。並要做好防寒保溫的準備。
用舊床土或用藥地做苗床育苗時，一定要換用無病的新土或進行土壤消毒。土壤消毒的藥物或用40%五氯硝基苯1份加50%福美雙1份混勻；或用40%五氯硝基苯7份加58%瑞錳鋅3份混勻；或用50%多菌靈可濕性粉劑都可以。每平方米用藥8～10g。具體消毒方法是按苗床面積大小稱取藥量，先用少量細乾土與藥粉混勻，然後再加10～15kg細乾土，充分混勻，配成藥土。播種前苗床要先澆透底水，待水滲下後，用1/3的藥土撒在床面，然後播種，播種後再將剩下的藥土覆蓋在種子上面。此外，也可以用福爾馬林消毒。
苗床管理要特別注意控制苗床溫濕度，預防苗床病害發生。在苗床管理過程中要注意防止傳染病毒病，適當蹲苗，噴灑生長素，提高藥材抗病力，還要注意防治地下害蟲。
五、選擇抗病優質高產良種及種子消毒
在藥材生長上種植優質高產品種是提高中藥產量的重要措施之一。但是有些品種高產不抗病，甚至高度感病，在病區種植這些高感品種，可能導致病害嚴重發生，造成減產。因此，[FS:PAGE]在選擇品種時，一定要注意品種的抗病性，在病區不要種植高感品種。
中藥品種抗病性的強弱區別於品種不同，故抗病強弱也不同。分別有免疫品種、高抗品種、抗病品種、耐病品種；還有感病品種、高感品種等。對這些品種的選擇標準首先是要高產與抗病。因為優良品種能大大提高了產量和品質。但是我們還要看到，在品種選擇與推廣過程中，有些品種抗病，能控制病害的發生流行；有些品種感病，又能導致病害的發生流行。故高產優質抗病的品種有相對比較理想的品種，但是要育出這樣十全十美的品種是很困難的，在育種過程中往往有所得，也有所失。因此，根據每種中藥品種抗病蟲的能力、產量高低、品質好壞各不相同，要選擇適合當地種植的高產、優質、抗病品種，這是防治中藥病蟲害的措施之一。
抗病品種在防治病害中雖然重要，但是它不是萬能的，並不能解決所有的中藥病蟲害問題。要保持品種的抗病性，發揮品種抗病性的作用，就要注意解決以下問題。
１鑒於抗病品種不是萬能的，也會喪失抗病性，有的抗病性不強，有的抗某種病害而感染另一些病害。因此，要科學利用抗病品種，且要配合其他的防病措施，才能充分發揮品種抗病性的作用；
２不要長期種植一個品種，品種要輪換種植和搭配種植；
３要年年選種，保留抗病品種的種性；
４良種良法一起推廣。即推廣抗病品種時要採用相應的GAP優良栽培方法。此外，在做好高產抗病良種選擇的同時，還要做好種子檢驗工作。對從外地引進的藥材種子要進行檢驗，以防止外地危險病蟲引進來。如調進中藥塊根種薯要注意防止癌腫病、粉痂病、黃化矮縮病、人參金線蟲、天麻塊莖蛾等的傳人。還有十字花科類根腫病、半夏潰瘍病、貝母星黑病等也要注意傳入。因為許多中藥的病蟲害是通過播種帶有病菌的播種材料（種子、種薯等）而傳播給下一個生長季節，還可以通過調運帶有病菌的種苗而向外傳播。
因此，選用不帶病菌的播種材料播種，是防治作物病害的重要措施之一。常用的種子消毒方法有：
1．藥液浸種 按一定的濃度配成藥液，然後將種子浸入藥液中經一定時間後撈出即可。如番茄種子用清水浸泡3～4min後，再浸入10%磷酸三鈉液中浸泡20～30min，撈出後用清水沖洗乾淨，即可清除種子所帶的病毒。
2．溫湯浸種 如艾子種子在55℃溫水中浸種10min即可殺死種子上的褐紋病菌。
3．藥粉或藥灰拌種 取一定量的藥粉或藥灰拌在種子上即可。
4．藥土墊種或蓋種
六、選擇適宜的播種期和播種方式
中藥播種期的早晚對病蟲害的發生有一定的影響。如穿心蓮在南方4～5月播種育苗，易發生立枯病、枯萎病和疫病，導致嚴重減產；若在2～3月初播種，則可避免或減輕這些病害，從而獲得高產。紅花春播易患炭疽病、枯萎病與菌核病，降低產量；如果實行秋播則大大減少這些病害的發生，而免除噴施農藥，減輕污染，獲得少投資，高收益。故可以通過調整播種期，實現高產防病。
播種方式不同也會影響藥材的產量質量和病蟲害的發生為害。如雞骨草、金錢草等中藥實行直播可減少根腐病與立枯病的發生；若採取育苗移栽方式則上述病害嚴重發生，產量降低。
栽植方式不同與中藥的病蟲害發生及產量亦有關係，如板藍根高畦栽培軟腐病輕，平畦栽培軟腐病重，再有栽培株行距的配置，過密時田間陰濕，通風透光不好，易發生病害；過稀時產量下降。中藥的種植方式還要注意，多次采收葉、果的藥材高畦栽培，有利於植株傷口癒合，減少軟腐病菌的侵染，發生病較輕。菊花高壟栽培，深溝灌水，加大晝夜溫差，可以減輕病毒退化病發生為害。間作套種的藥田在播種時要留好位置。育苗移栽的藥田同樣也需要選擇既能高產又能控制病蟲害的種植方式。
七、田間管理
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田間管理包括許多工作，如間苗定苗、移栽、中耕除草、肥水管理、整枝摘心、搭架綁蔓、打老葉等，這些措施都與病蟲害發生有關係。在操作過程中還可能傳播病害，如通過手的接觸傳染病毒病。
藥田栽培管理措施是多方面的，首先要弄清各種栽培管理措施與病蟲害發生的關係，再「對症下藥」。如預防西紅花病毒病的發生，北方有三水齊苗，五水一苗，降低地溫，預防病毒發生。南星魔芋灌水前要先拔除軟腐病株，預防流水傳病。土壤乾旱時及時追肥澆水。薏苡定植後至座果期連續噴50～100ppm增產靈，都可以提高薏苡仁的抗病力。
及時中耕除草、整枝摘心、搭架綁蔓、去老葉等有利於藥田通風透光，降低田間濕度，可減輕病害的發生。田間工作前要先用肥皂水洗手，工作時不要吸煙，操作時先管理健株，後管理病株，可以減少病毒病在田間的傳染。及早摘除病葉、病果、拔除病株，搞好田園清潔，可以減少田間早期病菌的數量，推遲病害發生流行時期。及早剷除田邊和田間雜草，如薺菜、栝樓、羅漢果等，這些雜草上帶有黃瓜花葉病毒，剷除該雜草就可減輕黃瓜花葉病的發生。雨後及時排除積水，可以減輕顛茄子褐紋病和綿疫病發生。
在肥水管理方面，生長期要及時追肥澆水，可以減輕病毒病發生為害。不要偏施氮肥，適當追施磷、鉀肥，可以提高藥材的抗病力，減輕病害的發生。田間管理施肥時底肥要施足夠的有機肥，培養地力，提高藥材的抗逆力。有機肥中往往混有病株殘體，施到地裡就會傳播病菌。因此，有機肥一定要經高溫堆肥後再用。藥田施用未腐熟的有機肥往往引起種蠅和地下害蟲發生為害。要增施磷、鉀肥作底肥，提高中藥的抗病力。
八、收穫與貯藏期的防治
中藥收穫期的預防措施，重點在收穫前要選無病單株留種，以防種子和種株傳病。選留抗病品種，淘汰感病品種。適時收穫成熟的種子。種子要充分曬乾，貯藏期不要受潮發霉和混雜，保證種子質量。藥材收穫後許多病株[FS:CONTENT_END]
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