胡黃連味苦,性寒,屬寒涼藥。主要有消疳積、退勞熱的作用。小兒不注意飲食或有寄生蟲病而致傷害脾胃,影響消化,漸致疳積(腹大青筋、食慾不振、四肢消瘦,下午低熱、頭髮乾枯打縷、脾大等),可用胡黃連配焦三仙、檳榔、炒內金、木香、炒萊菔子、枳實、白朮、地骨皮、使君子等同用。胡黃連也可用於濕熱痢疾,常配合木香、檳榔、白芍、當歸、白頭翁等同用。對於陰虛勞熱(下午發熱、手足心熱、人體漸漸消瘦、兩顴發紅),可用本品配地骨皮、白薇、百部、沙參、青蒿、炙鰲甲、秦艽、生地、元參等同用。品小兒科使用最多,常用於小兒身熱驚風、疳積等症。
胡黃連細粉用乳汁浸調點眼能治療肝經風熱所致的目昏、目赤等症,效果良好。川黃連清熱瀉火,偏用於濕熱毒盛、痢疾、瘡毒等實熱證。胡黃連主用於陰虛發熱、小兒疳積、驚風等症。用量一般一至三錢。外感發熱及脾胃虛寒者忌用。