硃砂味甘，性微寒，屬補益藥範疇。為重鎮安神藥，並有解毒作用。硃砂性寒，質重，入心經，有清熱、鎮驚、安神的作用。由於心火太盛或心經痰熱所致的驚悸，癲狂，失眠等症，可用本品配黃連、生地、當歸、甘草（硃砂安神丸）等同用，或配磁石、神曲（磁朱丸）同用。硃砂不入湯藥，常作為丸藥用（如上述丸藥）或作為細粉沖服。例如上述症可用黃連，生地、遠志，天竺黃，郁金、生鐵落等煎湯，送服硃砂粉二，三分。也有時作為丸藥的外衣用。曾用香附，白芍。黃芩，黃連，天竺黃、菖蒲、遠志、郁金，生赭石，生牡蠣，生鐵落等隨症加減，沖服硃砂二，三分用於精神分裂症狂躁不安者有一定效果。
硃砂性寒，清熱、安神，故也常用於清暑熱、安心神的藥劑中，如益元散（滑石，甘草，硃砂）等人丹、避瘟散等祛暑藥中也常有硃砂。
前人有「諸痛庠瘡皆屬於心」的理論記載，認為血中有火熱可生毒瘡，癰腫等症。硃砂能清心熱，也是外科，喉科常用的清熱解毒藥品。例如配殭蠶、硼砂為細末，吹喉用，可用於急性扁桃體炎、咽喉腫痛等等。治咽喉病的古方「玉鑰匙散」即為西瓜霜、西月石、飛硃砂、殭蠶、冰片所組成。是有效的吹喉劑。
珍珠母安神主要是養心陰，降心火。硃砂安神主要是鎮驚清熱。
生鐵落重鎮心肝，墜痰下氣，偏治癲狂善怒。硃砂鎮心降火，偏治心經邪熱，神昏譫妄。
用量；一般一至三分，隨湯藥沖服。重症有時可用到五至八分。
據近代研究硃砂可降低大腦中樞神經興奮性，有鎮靜作用。
注意硃砂不可直接見火，以免分解出金屬汞而至中毒，不可用過大劑量，不可長期服用，以免中毒。
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