阿魏入藥性溫，味苦辛，歸肝、脾、胃經。據測定，含有揮發油、樹脂和樹膠等成分，具有消積、殺蟲的功效，常用於治療癥瘕痞塊、蟲積、肉積、心腹冷痛、瘧疾、痢疾等症。《本草經疏》載：「阿魏，其氣臭烈殊常，故善殺諸蟲，專辟惡氣。辛則走而不守，溫則通而能行，故能消積，利諸竅，除穢惡也。」現代藥理研究表明，其有效成分能自腸道吸收，可作驅風劑灌腸之用，亦可作刺激性祛痰劑，用於支氣管炎、百日咳或哮喘患者；其煎劑對結核桿菌有抑製作用；阿魏水浸劑能延長血凝時間，並能顯著降低血漿對肝素的耐受力。國外報道，阿魏含有較多的膠質，可用作抗驚厥或治療某些精神病，還有的用於驅蟲。臨床報道，有人以阿魏為主組方，配以柴胡、甘草、當歸須、赤芍、桔梗，水煎服，治療血管瘤取得良好效果，隨訪6年未見惡化。
阿魏內服多入丸、散；外用可熬製膏藥或研末入膏藥內貼敷。
由於阿魏過去一直是進口，所以貨源相對緊缺，於是市場上有以蔥屬植物的鱗莖加工仿製的偽品，冒充阿魏。真品阿魏多數由球粒凝聚而成大小不等的塊狀。外表暗黃色或黑棕色，貯藏日久，則變為紅棕色。新採集的阿魏，斷面為乳白色或淺黃棕色，或有紅棕色交錯其間，被稱為「五彩阿魏」；質如脂膏狀物，硬度如白蠟；加水研磨，成白色乳狀液。由於含有近20%的揮發油，所以具有強烈而持久的大蒜樣臭氣，故又稱「臭阿魏」，用口嘗之味苦辣如蒜樣。而加工的偽品外觀呈不規則塊狀或顆粒狀，表面黃棕色或棕褐色，略具光澤，斷面不具有正品的特徵；質地較疏鬆，手碾之易碎；水研不具有真品的上述特徵，也不具有真品特殊的蒜臭氣，聞之僅具有蔥蒜氣味，但不強烈。《本草綱目》記載了當時廣為流傳的諺語：「諺云：黃芩無假，阿魏無真。」並一針見血地指出：「以其多偽也。」可明代著名醫學家卻言「阿魏無真卻有真，臭而止臭乃為珍」。這說明阿魏有真有假，使用時要仔細辨之。
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