他成立了全國第一家中醫耳鼻咽喉科。建立了「干氏中醫耳鼻喉科理論體系」，被全國同行認同。制定兩個被全國規範化教材選用的新病種：多涕症和喉源性咳嗽。出版《中醫耳鼻喉科學》，主編多部中醫耳鼻喉科教材。
干祖望，男，1912年9月生，上海松江人，農工民主黨黨員，教授，南京中醫藥大學附屬醫院主任中醫師。
1929年至1933年師從浙江名醫鍾道生，1953年至1954年在中央機關直屬第二醫院耳鼻喉科進修。中華中醫藥學會耳鼻喉科專業委員會主任委員、名譽主任委員，第一批全國老中醫藥專家學術經驗繼承指導教師，享受國務院政府特殊津貼專家。2005年科技部「名老中醫學術思想及臨證經驗傳承研究」100名中醫學家之一。1985年被江蘇省政府授予江蘇省優秀教師獎，2003年被中華中醫藥學會聘為終身理事，2006年獲中華中醫藥學會首屆中醫藥傳承特別貢獻獎，2009年獲中華中醫藥學會全國先進名醫工作室獎，2011年獲江蘇省醫師終身榮譽獎。
一、臨床實踐1952年在上海松江首次開設中醫耳鼻咽喉科，北京進修後成為第一位掌握現代耳鼻喉科知識的中醫師。1972年成立全國第一家中醫耳鼻咽喉科，創「鼻淵合劑」、「參梅含片」、「還聽丸」等新藥；主持成立「嗓音病」、「過敏性鼻炎」等專病門診。從醫八十年，譽滿海內外。
二、創新學術建立了「干氏中醫耳鼻喉科理論體系」，並為全國同行認同。
（一）五診學說：認為除望聞問切四診外，增加耳鼻喉科「查診」，成為具有特色的「五診」，有利於辨病和辨證。如在喉科打破了「金實不鳴、金破不鳴」的傳統理論。
（二）耳鼻喉科脾胃學說：用補中益氣湯治療慢性咽炎，打破了「白朮不入喉科」古訓。還善用健脾益氣法治療鼻炎、中耳炎等。
（三）嗓音學說：提出「喉有五屬：無形之氣者，心為音聲之主，肺為音聲之門，脾為音聲之本，腎為音聲之根。有形之質者，聲帶屬肝，得肺氣之鼓舞而能震顫；室帶屬脾，得氣血之濡養而能活躍；會厭、披裂屬於陽明，環杓關節隸乎肝腎。」對嗓音醫學很有指導意義。
（四）「中介證」學說：把外感六淫侵犯人體而直接致病者列為一級中介證；把內傷七情致病的證候、六淫致病後轉化而生的證候(如風化燥、寒化熱)以及繼發致病因素(痰飲、瘀血)等致病者列為二級中介證；把病情重篤的證候列為三級中介證。
（五）溫陽法治療過敏性鼻炎：他根據患者鼻涕清稀、遇寒加重等特點，提出溫陽補腎法治療過敏性鼻炎，後來成為全國同行最常用的方法。
（六）耳聾治肺、鼻塞治心：耳病治腎、鼻病治肺為常法，他發現有些耳聾，伴有鼻塞、流涕等症，用三拗湯有效，符合「耳聾治肺」；用入心經的活血化瘀藥治療慢性肥厚性鼻炎，則稱為「鼻塞治心」。
（七）瀉離填坎、伐震潤兌：心、腎、肝、肺，分別與「八卦」的離、坎、震、兌相對應。善用清心火、補腎水、平肝陽、潤肺燥，即瀉離、填坎、伐震、潤兌四法。
（八）粘膜病證「十辨」：歸納了辨色澤、辨疼痛、辨腫脹、辨腫塊、辨斑點、辨潰爛、辨假膜、辨癢、辨膿血、辨氣味的專科特色辨證。
（九）制定兩個被全國規範化教材選用的新病種：多涕症和喉源性咳嗽。
三、科研成果主持、指導完成國家自然科學基金課題1項、科技部課題2項、部省級課題6項，獲部省級科技進步獎2項。1980年起主辦6期全國中醫耳鼻喉科進修班，為全國各地及海外培養大批專科人才。1956年出版《中醫耳鼻喉科學》，主編多部中醫耳鼻喉科教材。1992年出版代表作《干氏中醫耳鼻咽喉科學》，20世紀80年代以來，發表論文、醫話等400餘篇。
四、藏書狀元干祖望一生的最大愛好是藏書和讀書。家藏萬餘冊書籍被分成工具書、叢書、醫史、醫經、本草、方劑、耳鼻咽喉口腔科、各家醫籍、醫案、西醫等10個大類，一以其藏書之多取勝，二以其理書有序而出眾。1990年被南京文化界評為「藏書狀元」。他將自己的書房命名為「繭齋」，並且自題詩曰：「我事塗鴉你吐絲，兩般姿態一般癡；年年自縛琅繯裡，樂僅廬陵太守知。」足見他對書的感情之深。
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