種育苗一般於立秋前後隨采隨播，在氣溫稍高的低海拔地區宜於8月中旬至9月上旬播種。適時播種可避免當歸早期抽薹。過早，幼苗生長期長，苗旺易提前抽薹；過遲，生長期短，氣溫已下降，幼苗生長不良。採用條播，在整好的畦面上按行距25厘米開橫溝，溝深3～5厘米，溝底整平。播前，將種子放入25～30℃溫水中浸泡24小時，取出晾乾後均勻地播入溝內，覆蓋細土，以不見種子為度。最後在畦面上蓋草厚約3厘米。每公頃用種量60～75千克。播後15天左右出苗。1個月後當幼苗高1～2厘米時，選陰天先輕輕地抖松蓋草，然後小心揭去，以免幼苗鑽入草縫中，造成傷苗。揭蓋草後，見雜草就除，保持田間無雜草，並結合除草進行間苗，去弱留強，保持株距1厘米左右為宜。於10月中、下旬，當苗葉黃枯時，挖起幼苗，將小苗捆成5～6厘米粗的小束，切去上部莖葉，根部稍帶部分泥土，晾乾水氣後進行窖藏；亦可於室內高燥向陽處，挖一大小適中的坑，深60厘米左右，坑底先鋪一層厚5～7厘米的細沙土，其上鋪放種苗1層，再蓋1層細沙，如此相間鋪放至離坑頂15厘米時，用乾土封口，厚約30厘米，坑頂做成龜背形。亦可用細沙土把種苗層積貯放於特製的方形竹簍內，置於室內陰涼乾燥處貯藏。此法簡便，易管理。
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