枸杞整形修剪和摘心對調節生殖生長和營養生長作用很大。當年生、二年生的結果枝條結果能力最強，多年生和二年生春枝條為最佳。掌握這些結果的習性，對合理修剪有著重要的指導作用。
一、修剪原則 修剪包括整形和剪枝兩部分。採用合理修剪，能有效地改善樹冠內部通風透光條件，對加速形成擴大樹冠、平衡樹勢有著重要的作用。使樹體生長健壯，增強抵抗力，增加結果枝條，使新梢旺生，防止徒長和早衰，調節生長和結果的關係，促進花芽分化。從而使幼樹早結果、早豐產，使成樹高產穩產，延長盛果期，提高果實品質。
二、整形方法 枸杞整形後的樹形，主要可分為疏散分層形、自然開心形、自然叢狀形。對不同的樹形和同一種樹形的不同生長年限的枸杞，修剪的要求也不相同。但無論怎樣，要求定植後的當年，就要根據樹形主意合理整形，使主幹、主枝、側枝、小枝層次分明。
1、疏散分層形：定干高50厘米左右，有中心主幹，將頂端20厘米以下萌發的芽或枝條全部抹掉。在頂端20厘米處，選留3個主枝，各相距10厘米左右，作為第1層，每個主枝上各留側枝2～3個，待下年再在主幹向上選留2～3個主枝，作為第2層，同樣在枝上各留側枝2～3個，依次類推，可留3～5層。最上層主枝側枝可減少一個。樹高達 1.6米 左右，冠徑 1.5米 左右，此樹成形早。粗壯，載果量大。
2、自然開心形：定干高20厘米，無明顯中心主幹，在干的基部選留3個主枝，各相距15厘米左右，夾角為30°左右，每個主枝上留備2～3個交錯分佈的側枝，側枝各相距30厘米左右。在主側枝上選留若干個斜生小枝，樹形2～3年即可形成。此樹形通風透光良好，結果早，產量高，品質好。這種整形方法容易，剪枝量小，管理方便。
3、自然叢狀形：無中心主幹，從地面直接生出3～4個主枝，每個主枝交錯配3～4個側枝，除第1側枝距主枝基部40～50厘米外，其他側枝各相距30厘米左右，在主側枝上選留結果小枝，此樹形通風透光良好，有利充分利用空間達到立體結果。剪枝和整形不可分割。
三、剪枝方法 剪枝又分秋剪、春剪和夏剪三種。對一年生、二年生和三年生以後的枸札剪枝要求不一樣，應嚴格把握。
1、秋剪枝：時間為10月中旬至11月中旬，按三去三留的要求，剪除非生產性的枝條，更新結果枝。這樣可增加植株營養貯備，提高下年結果量。
2、春剪枝：時間為3月下旬至4月上旬，主要是彌補上年秋剪枝不足，剪足冬季乾枯的和帶刺的枝條，枝條密的要疏剪，進一步完善樹冠內部的光照條件。對二年生的枸杞，春剪一年生的枝條時，主枝留長30～40厘米，側枝留長20厘米左右，主側枝上有空隙處的小枝條留長8～10厘米，空隙較大處的枝條結果率的關鍵，主要是選留二年生枝條。主側枝留長40～50厘米，小枝留長20～30厘米。側枝上每隔15厘米左右留一小枝，培養結果枝組。通過修剪的植株，樹冠已定形。
3、夏剪枝：時間為6～8月，主要剪去剪口、鋸口下和主枝、主幹上、根部的萌芽、根櫱及徒長枝，以減少營養消耗。但要注意保留補充空間用的輔助結果枝，以作主枝。當新定植的枸杞發出二次枝，老枸杞新發出的枝條，在長到40～60厘米時，或在樹冠空間生出的枝條長到20～30厘米時，應及時摘心剪梢；對周圍長出多餘的枝條要提前抹芽除萌，使營養集中，促進樹冠內外開花立體結果。也促使這些枝條中下部發出較多的新枝條，培養更多的結果枝組，這對提高枸杞當年產量效果明顯。對延長枸杞結果年限有很好的作用。
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