銀杏經過若干年的遺傳變異，形成了許多變種。根據種核的長寬比例將銀杏品種劃分為5大類。
1、長子類 種核紡錘狀卵圓形，一般無腹背之分。上端三純．下部長楔形。兩側稜線上部明顯，下部僅見痕跡。品種有金墜子、橄欖果、粗佛子、圓棗佛手、金果佛手、葉籽銀杏、余廠長籽、天目長籽、九甫長籽等。
2、佛指類 種核卵形，腹背面多不明顯。種核下寬上窄，二禿尖。兩側稜線明顯，不具翼狀邊緣。品種有佛指、七星果、扁佛指、野佛指、尖頂佛手、洞庭佛手、早熟大佛子、野尾銀杏、長柄銀杏、小黃白果、青皮果、黃皮果、貴州長白果、長糯白果等。
3、馬鈴類 種核寬卵形或寬倒卵形，大部上寬下窄，一般三背腹之分。種核最寬處有不明顯的橫脊。種核先端突尖或乏尖，兩側稜線明顯，中部以上尤顯。品種有海洋皇、馬鈴、白果、圓底果、圓錐佛手、汪槎銀杏、李子果等。
4、梅核類 種核近卵形或短紡錘形，上下寬度基本相等。三端圓禿，具微尖，兩側稜線明顯，中上部呈窄翼狀，有時延至芸部。品種有梅核、棉花果、珍珠子、眼珠子、廬山銀杏等。
5、圓子類 種核近圓形或扁圓形，腹背面不明顯。一般較馬鈴為小，上下左右基本相等。上端鈍圓，具不明顯之小尖，兩側稜線自上而下均基本明顯，並呈翼狀邊緣。
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