中草藥的采收,受多種因素的制約,除了如耕作制度等社會因素外,對於有效成分的積累尚受一些自然因素的影響,因此在采收中草藥時,也應加以考慮。如興安杜鵑(Rhododendron dauricum L.)在同一時期采收,由於產地不同,揮發油的含量有很大差異,含量可相差3~6倍。
從經緯度來看,中草藥中揮發油的含量越向南越高,而蛋白質的含量越向北越高。金雞納樹皮中的生物鹼含量隨溫度增高而增高,而亞麻中的不飽和酸則氣溫越低,含量越高。茄科某些植物,當寒潮來到時,其中晶形生物鹼會變成非晶形沒有療效的生物鹼。
薄荷即使栽培在同一地塊,如陽光充沛,揮發油含量高,且油中薄荷腦的含量也高,若陰雨連綿,或久雨初晴2~3日內來收,含油量下降至正常量的3/4。
曼陀羅在鹼性土壤中生長,生物鹼含量高,薄荷在砂質土壤中生長,揮發油含量高。