立枯病：最初是幼苗基部出現褐斑，進而擴展成繞莖病斑，病斑處失水干縮，致使幼苗成片枯死。此病危害黃芪、杜仲、人參、三七、白朮、北沙參、防風和菊花等。防治辦法：降低土壤濕度，及時拔除病株，並用多菌靈等處理土壤，噴藥預防其他健株感染。枯萎病：發病初期，下部葉片失綠，繼而變黃枯死。重茬地、排水不良的粘土地發病嚴重。黃芪、桔梗和荊芥等藥材常感染此病。防治辦法：應與禾本科作物輪作，發病初期用多菌靈、甲基托布津等藥劑噴灑處理。
根腐病：先由鬚根、支根變褐腐爛，逐漸向主根蔓延，最後導致全根腐爛，直至地上莖葉自下向上枯萎，全株枯死。該病常與地下線蟲、根螨為害有關，在土壤黏度重、田間積水過多時發病嚴重。黃芩、丹參、板藍根、黃芪、太子參、芍葯和黨參等易感染此病。防治辦法：播前用丙線磷等殺蟲藥劑撒施整土，防治地下害蟲，同時施腐熟有機肥，以增強抗病力。發病初期可用甲基托布津、多菌靈800～1000倍液灌根，雨後及時排水。
根結線蟲病：由於根結線蟲的寄生，在藥材根部長了許多瘤狀物，致使植株生長緩慢、葉片發黃，最後全株枯死。此病危害丹參、桔梗、黃芪、人參和北沙參等。防治辦法：最好與禾本科作物輪作或水旱輪作綜合防治。1.土壤消毒。在播種或定植前，每平方米用菌線威0.3～0.5克，兌水3500～7500倍液或對過篩濕潤細土200～500倍均勻噴灑或撒施在土表上，有條件的可用地膜覆蓋48～72小時；或每畝用5%線淨3～4千克，拌細土均勻施入播種溝或播種穴內。2.生長期(發病期)。用菌線威3500～7000倍液，澆灌植株基部。
菌核病：發病時幼苗基部產生褐色水漬狀病斑，幼莖很快腐爛，造成倒苗死亡。病部後期出現的黑褐色顆粒即為菌核。此病危害丹參、人參、白朮、半夏、川芎、川蒡、延胡索和牡丹等。防治方法：除實行輪作外，還要在發病中心撒施石灰粉，植株上用多菌靈或禾枯靈水溶液噴灑。
白絹病：常在近地面的根處或莖基部，出現一層白色絹絲狀物，嚴重時腐爛成亂麻狀，最終導致葉片枯萎、全株死亡。常在雨季或土壤受漬條件下發病。此病危害黃芪、桔梗、白朮、太子參和北沙參等。防治辦法：應與禾本科作物輪作或用多菌靈、甲基托布津液浸種消毒。
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