用中草藥代替抗生素來防治疾病，不易產生抗藥性和毒副作用，也不會污染水環境。而且，中草藥對水產動物具有調節機體平衡與生理功能、提高機體特異性和非特異性免疫力、提高消化吸收、增強體質、促進生長的作用，此外還具有抗菌、抑制病毒等方面的作用。因此，在蝦蟹人工育苗過程中，應提倡使用中草藥夾防治疾病。
一、魚蝦類育苗中的致病因素
1．育苗池水環境不良：魚蝦類育苗是在人工控制的條件下進行的，由於幼體培育密度較高，投餌量較大，其殘餌和代謝廢物的累積易使池水環境變差(如PH值降低，氨氮及硫化氫含量上升)，病原微生物滋生，引起幼體致病。
在育苗過程中使用中草藥防病，一方面可以調節幼體的代謝平衡，避免產生機能障礙；另一方面，中草藥中的一些有效成分可以通過生物的、化學的、物理的作用，影響育苗池水環境，使其向著有利於幼體生長、發育的方向轉化，而起到防病的作用。
2．幼體的餌料營養不良：在蝦、蟹育苗過程中，由於生物餌料(單胞藻、輪蟲、鹵蟲、橈足類等)的不足或是為了節省餌料成本，而較多地使用人工餌料(如雞蛋黃、蛋羹、豆漿、藍藻粉、蝦片等)，常常造成幼體消化吸收不良，營養不全，使幼體體質下降，對病原菌的抵抗力減弱，而容易患病。
中草藥的調整作用具有調節幼體的生理功能，通過增強幼體對餌料的消化吸收，改良其代謝機能，從而對部分營養失調的餌料可起到一定的平衡作用，防止疾病的發生。此外，有些中草藥還具有明顯的誘食性。
3．有害微生物：雖然在魚蝦類育苗過程中對育苗用水進行了選擇、沉澱、砂濾、消毒處理，但細菌、真菌、病毒等有害微生物不可能完全被殺滅，隨著育苗的進行，它們會滋生、發展、侵害幼體。
二、魚蝦類育苗中常用中草藥及其有效成份與作用
中草藥的化學成份極為複雜，一種中草藥往往含有多種化學成份，但不是所有的成份都能起到防治疾病的作用，能防治疾病的有效成份主要包括多糖、生物鹼、甙類、揮發油、鞣質等。
1．大蒜：大蒜具有廣譜的抗菌作用，對病毒和原蟲等都有殺滅作用，屬高效抗菌殺蟲中草藥。在用作殺菌劑時，應新鮮制備，立即使用。
2．黃連：其有效成份為小檗鹼(即黃連素)。黃連具有廣譜抗菌作用，能抑制多種革蘭氏陽性和陰性細菌的生長，對多種真菌有抑製作用，對一些病毒、原蟲等也有效。另外，小檗鹼還具有增強動物吞噬細胞的吞噬能力的作用。
3．黃芩：黃芩甙和黃岑甙元是其主要有效成份。黃芩具有較廣的抗菌譜，對革蘭氏陰性和陽性球菌均有抑製作用，對一些病毒和多種真菌也有一定效果。
4．大黃：大黃含有大黃素、大黃酸、蘆薈大黃素等葸醌類衍生物，具有抗菌、抗真菌、抗病毒的作用，對屈橈桿菌有明顯的抑製作用。此外，還具有收斂、瀉下、增加血小板、促進血液凝固的作用。
5．五倍予：五倍子含有鞣質、沒食子酸等成份，對革蘭氏陽性和陰性細菌均有抑製作用；對真菌(水霉病)具有良好的防治效果；還具有止血、解毒、收斂等作用。
6．大青葉和板蘭根 大青葉是十字花科植物菘蘭和爵床科植物馬蘭、蓼蘭的葉子，板蘭根就是菘蘭的根。其有效成份為大青素、靛藍甙等。二者均有廣譜抗菌和抗病毒作用及清熱解毒作用。其中板蘭根的抗病毒作用較強。
三、魚蝦類育苗中中草藥的使用
1．使用方法：魚蝦類育苗中中草藥的使用可以一種藥單獨使用、出可幾種藥配伍使用。常用投藥方法有：１藥浴法，將鮮草藥搗碎或將干中草藥煎成汁或粉碎浸泡取汁，均勻潑灑於育苗池中；２藥餌法，新鮮草藥搗碎後拌人餌料中投喂，干中草藥粉碎成細粉或煎成汁製成藥餌投喂。
2．使用劑量：根據作者在魚蝦類人工育苗病害防冶中中草藥的使用實踐，採用藥浴法時中草藥一次的使用劑量為2-5克／立方米 ；採用藥餌法時干中草藥粉碎後按餌料重量(干重)0．5％—1．0％的比例拌人餌料中投喂。
由於中草藥在魚蝦類人工育苗中的應用研究很少，一些育苗廠只是根據經驗在使用。究竟哪些中藥最適於在魚蝦類人工育苗中使用，以及中藥的有效使用劑量、作用機理等，還有待於以後進一步深入研究。
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