根腐病 夏季高溫多濕、低窪積水的地塊，常發生此病。根腐病主要危害根部，使根部分或全部變色腐爛，莖、葉因根無法供應水分而下垂、乾枯。選排水良好的地塊輪作，翻曬土壤，發病初期用50％石灰水澆根或用1％硫酸亞鐵消毒，可以防治根腐病。
葉斑病 高溫、多濕、田間通風不良、植株生長衰弱時發生較多。它主要在葉上形成黃褐色或紫色、各種形狀的斑點，後期病斑擴大互相連接成片，受害嚴重的，葉片乾枯脫落。輪作，對種子或種苗用多菌靈或代森錳鋅600～1000倍液消毒，可防治該病。
立枯病 陰濕地塊的藥材早春遇低溫，施未充分腐熟的肥料易發立枯病。幼苗發病較多，染病後，在貼近土表處幼莖基部出現黃褐色病斑或基部全部變色、乾枯，上部枝葉枯黃倒伏而死亡。輪作，種植密度合理，在立枯病發病初期用退菌特可濕性粉劑1000倍液或代森錳鋅70％膠干粉300～350倍液噴霧，或拌細土撒於莖基部，可防治立枯病。
銹病 多雨、多霧季節，土壤潮濕、植株生長柔嫩的田塊易發此病。發病時，莖葉上出現黃色或深褐色圓形或長圓形病斑，後期病斑鼓起，表皮破裂，飛散出黃色或褐色粉末，病斑處破裂穿孔，葉片枯死。開溝排水，防止田間積水，發病初期噴97％敵銹鈉400倍液或波美0.3度石硫合劑，早期清除病株病葉，可防治銹病。
黑粉病 莖、葉、穗均可感病。發病株莖葉彎曲、畸形，形成小瘤狀，外面有層白膜，後期破裂，散出黑粉。穗感此病，則不結籽。輪作，種子消毒，早期拔除病株，收穫後清田，可防治黑粉病。
菌核病 多發生在土壤潮濕、溫度低的地塊。根莖葉均可感病。發病後，莖葉發軟，根系腐爛，植株倒伏。濕度大時，病部發生很多棉絮狀的白絨毛，後期形成黑色鼠糞狀的菌核。輪作，雨後排除田間積水，拔除病株，將草木灰、石灰粉撒入病穴消毒，用退菌特600倍液噴霧，可防治菌核病。
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