一、病害
平貝母病害對其產量影響非常大，輕者影響當年產量，重者缺苗、斷條，甚至全園毀滅，絕收。
1、銹病 危害貝母莖和葉，5月份開始發病，首先在葉的背面和莖的下部出現黃色圓形病斑，以後逐漸擴大，並生成黃色粉末隨風飄揚，落到其它貝母植株上浸染髮病，傳播非常迅速，造成早期倒秧，影響產量。防治方法：
A、春天小滿過後，把貝母病株及雜草清理乾淨；
B、每年施「蓋頭糞」和無機化肥（磷、鉀肥）；
C、藥劑防治：春天小苗展葉後噴施150倍等量式波爾多液，或用多菌靈、托布津800倍液每10天噴施1次，可完全控制銹病的發生。
2、菌核病 嚴重危害鱗莖，防治不及時會造成絕收。受病害浸染的鱗莖先是形成黑斑，逐漸發展至整個鱗莖而全變為黑色，地下部分萎枯死亡。菌核病發展迅速，今年病害面積1平方米，翌年就可發展到2平方米，病區大、小貝母全部死亡。防治方法：
A、採用有性繁殖，避免種栽帶土、帶菌，並進行輪作，1次起淨；
B、栽種時，每100kg種子用多菌靈1kg拌種消毒；
C、每年春、秋中耕時進行土壤消毒，每平方米撒施硫酸銅10g，然後再中耕，使藥劑與土壤充分混合；以上兩種藥劑春、秋交替使用；４發現病株連同周圍的土壤一起剷除，病穴用生石灰消毒。
通過對銹病、菌核病的防治，貝母的灰霉病、黃腐病可不治而愈。
二、蟲、鼠害
1、金針蟲（姜蟲）、蠐螬 均為地下害蟲，咬食貝母鱗莖。防治：可採用敵百蟲800倍液灌注。
2、地老虎（截蟲） 夜間咬食貝母苗，一般1只地老虎1夜能危害3～10株。防治：每667平方米撒敵百蟲粉2kg，或用敵百蟲800倍液噴灑。
3、螻蛄 咬食貝母鱗莖，截斷秧苗。防治：將玉米池子蒸熱，按每5kg拌50g敵百蟲比例做成毒耳誘殺，也可以用700倍液敵百蟲液灌注。
4、鼢鼠（瞎耗子） 食量很大，咬食貝母鱗莖，秋季還有貯存貝母鱗莖的習性。每天早、晚及陰雨天活動，怕光、怕風，聽覺靈敏，洞道若有通風通光，便來堵洞。防治方法：
A、利用其堵洞的習性，人工捕捉；
B、把鼠藥放在大蔥白裡，再把大蔥放在洞裡誘殺，效果很好。
5、鼴鼠（串地龍） 為食蟲動物，但其在貝母床內串洞，使貝母苗傷風而死。可在每天的早、晚及陰天出來挖洞時人工捕捉，或挖溝堵截。
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