一、種球採挖 當秋季氣溫開始下降，地上部莖已開始枯死，母球發育到一定程度，則選擇晴天挖取種球。採挖前一定要把地上部已枯死的莖拔取集中燒燬，以減少病原。同時注意採挖時不要損傷鱗片，或去除損傷的鱗片，以減小腐爛。
二、種球貯藏前的處理 種球在貯藏之前須進行分級、清洗、消毒、包裝等處理。
1、分級 一般地說，百合種球大，則開花數多，種球小則開花數少。因此，種球的分級有利於分別栽植樹，便於管理。採挖後，要把大小種球分開，分級的標準是母球為一組，子球為一組。同時注意以下幾方面：
若發現鱗片變爛，應及時清除。種球周長在12厘米左右的，可用於切花栽培。已經發芽或長新根的小種球可立即栽培，切忌損傷新根及新芽。對已長新根的大種球，應歸為一組，這組種球不能在-2℃溫度下低溫處理。
2、清洗 已挖取的種球視帶土的多少而決定是否清洗，帶泥土多者可進行清洗，對於砂質壤土中栽植的種球在晴天採挖的，可不必清洗。除去多的泥土，有利於貯藏前的消毒處理，又有利於消除土壤中的病蟲。
3、消毒 為防治病毒病、腐爛病及葉斑病等，要對種球進行消毒處理。消毒處理一般進行1-2次，第一次在種球進冷庫前進行，第二次在種球出冷庫後，種植前進行。如果是長期貯藏，即指8-12個月，則需進行上述二次消毒處理；如果是短期，即8個月以內，也可只進行上述的第一次消毒處理即可。
4、包裝 進行貯藏之前要加以包裝，以便於貯藏時期的管理。包裝物是經嚴格清洗消毒後的塑料薄膜。塑料薄膜須打孔14-18個，以便通氣。另外，還須使用其有一定含水量的填充物，可選用濕鋸木屑或苔蘚，注意填充物也須嚴格消毒，其含水量以手捏不出水來為準。包裝方法是，先把塑料薄膜放入箱內，然後在箱底放一層填充物，其厚度為5厘米，在填充物上放一層種球，注意同層種球之間必須由填充物相隔開，如此一層填充物一層種球，放滿箱後，將塑料薄膜合攏紮緊。
三、種球的貯藏 百合種球採挖後，為實現週年開花，則必須進行低溫處理和貯藏。
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