一、存在的問題：
1、病蟲害種類多，為害重、損失大。
由於藥材品種多，且一種藥用植物品種往往受到多種病蟲害的危害，同一品種種植的區域不同，也會產生不同的主要危害病蟲，若不採取防治措施，輕則減產，影響藥材品質，重則顆粒無收。
2、濫用、誤用農藥問題時有發現。
一看到有蟲就想到打藥，對農藥的選擇標準：一是有效，二是價錢便宜，很少考慮農藥毒性對藥材質量的影響，且使用方法不規範，如隨意加大用藥濃度，施用夫喃丹顆粒等，長期此下去，後果嚴重。首先是農藥在中藥材中的殘留問題，農殘超標，直接損害人體健康，阻礙中藥材走向市場；二是環境污染加劇，破壞了生態平衡，三是長期不合理用藥，病蟲抗性增加，使防治難度加大，防治成本增高，形成惡性循環。
3、專業人員缺乏，投入不足。
近幾年來，相關的專業技術人員做一個試驗、示範週期最短也要三、四年，且藥材種植品種更換頻繁，技術人員的技術更新跟不上企業的步伐，再則栽培藥材品種多，投入不足，在生產中管理跟不上。仍需加大投入，壯大科技隊伍。
二、對策：
一、中藥材和其它農作物相比，科學資料較少，生產實踐缺乏經驗，因此，應加大投入，加強對中藥材病蟲害無公害防治技術研究，積極指導生產實踐，在防治策略中積極推行綜合防治。
二、病蟲害防治方法
1、農業防治：
a合理輪作和間作。
b選用抗病蟲害品種。
2、生物防治：
a利用捕食性昆蟲防治害蟲，保護害蟲天敵如：螳螂、肉食瓢蟲，食蚜蠅等。
b以微生物治蟲，如利用白僵菌、綠僵菌等防蟲。
c昆蟲激素的利用等。
3、物理防治
包括用溫度、光、電滋波等物理方法防治病蟲害。如殺蟲燈誘殺害蟲、利用蚜蟲趨於黃色的特性，用黃板誘蚜等。
4、化學防治：其優點是使用方便、見效快、防治效果好，但由於近年來農藥用量大，不合理使用農藥和濫用農藥，造成農藥殘留及環境污染和病蟲害抗性問題。要考慮以下幾點：
a、使用對人、畜、作物安全的農藥品種。
b、化學農藥使用最低有效濃度，在使用的最適時期用藥、減少投入環境中的農藥量。
c、防治時應考慮主治兼治對象的綜合效果，要考慮對病蟲天敵和傳粉昆蟲的綜合影響，合理選擇藥劑種類、施藥時間和方法。
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