當歸含有揮發油和豐富的糖分，極易走油與吸潮，貯藏時溫度過高、時間過長或長期與空氣接觸，其油分容易外滲，使藥材表面出現油斑污跡，引起變質腐敗和走油；濕度過大或藥材本身含水量較高，則容易發生蟲害和霉變，因此烘乾後的當歸應貯存在乾燥、涼爽的地方，並認真做好消毒工作。
被貯藏的當歸應潔淨乾燥，含水量在13%以下，無霉變、蟲蛀。用雙層塑料袋密封後放入紙箱或木箱中保藏。貯藏的地方應選擇高爽、乾燥、潔淨、空氣流通的房間或倉庫，並使其內保持缺氧、低溫、乾燥、通風和避光。入庫前，貯倉要進行認真地清掃，必要時用甲醛消毒。當歸不宜貯藏太久，應及時加工應用。
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