一、采收
春播在當年霜降前後，秋播在第2年6～8月間，葉片呈枯萎時采收。采收選擇晴天進行，採挖時刨出全根，抖去泥土，除去莖葉，運回加工。
二、留種
1、原地留種收穫時，選留部分植株，待第2年即可抽薹開花結籽，以便采種。
2、選株留種收穫時，選主根無分叉，粗如拇指且健壯、無病蟲害植株的根作種根，按行株距40×80cm栽植，翌年種子成熟後，采收花序中部的種子留種。
三、加工
1、直接曬乾
晴天，剪去殘存葉基，抹去鬚根，按大、中、小分級，分別曝曬。
2、硫磺熏蒸
收後遇雨，去泥後應立即熏蒸；曬軟後如遇雨或雨淋應立即蒸熏；大白芷要蒸透後再曬。
熏蒸採用烘坑進行，先將白芷按大小和不同乾濕程度分別裝好，用草包或麻袋蓋嚴，每250kg鮮白芷約需3.5～4kg硫磺，熏時要不斷加入硫磺，不能熄滅，直至熏透。熏1晝夜後，取樣用小刀切開，在切口塗抹碘酒，如果藍色很快消失，即表明已熏透，可滅火停熏。假如藍色反應不消失，則需繼續熏硫。熏後應及時曬乾，包裝貯存在通風乾燥處。
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