漢代，隨著中藥方劑的發展，藥酒便漸漸成為其中的一個部分，其表現是臨床應用的針對性大大加強，所以其療效也進一步得到提高，如《史記·扁鵲倉公列傳》收載了西漢名醫淳於意的二十五個醫案，這是我國目前所見最早的醫案記載，其中列舉了兩例以藥酒治病的醫案，一個是濟北王患「風蹶胸滿」病，服了淳於意配的三石藥酒，得到治癒。另一個是茁川有個王美人患難產，淳於意用莨菪酒治癒，並產下一嬰孩。東漢·張仲景《傷寒雜病論》中，則載有「婦人六十二種風，腹中血氣刺痛，紅藍花酒主之」。紅藍花功能行血活血，用酒煎更加強藥效，使氣血通暢，則腹痛自止。此外，瓜蔞薤白白酒湯等，也是藥酒的一種劑型，借酒氣輕揚，能引藥上行，達到通陽散結，豁痰逐飲的目的，以治療胸痺。至於他在書中記載以酒煎藥或服藥的方例，則更為普遍。
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