中藥炮製是根據中醫中藥理論，按照醫療、調配和制劑的不同要求，對中藥所採取的各種加工處理技術。其目的在於降低或消除藥物的毒性或副作用，便於服用，提高療效。然而，受經濟利益的驅動，部分企業和機構忽視了我國歷代醫藥學家在長期醫療實踐中逐步發展起來的具有傳統特色的工藝。
存在的問題
中藥飲片不純淨。中藥飲片是所有方劑的原料。中藥藥用部分需要淨選、除去藥物中的泥沙、夾雜物以及霉敗品，分離其不同的藥用部位。而有些中藥飲片生產商，為了節省人力、物力和財力，都一一省去了這些必要的工序，將皮、莖、根、須混為一團，粗製濫造。甚至以次充好、以劣充優、摻雜使假，不僅嚴重地擾亂了醫藥市場，更嚴重的是影響了臨床用藥安全有效。
輔料標準不統一。藥物在炮製過程中，往往需要加入一些輔料與藥物一起
共製，如酒、醋、鹽、蜂蜜等，目的在於消除有害物質，發揮有利作用。同一味中藥，經過添加不同的輔料炮製後，作用各異。由於沒有一個統一的輔料標準，該用蜂蜜的用紅糖，該用食鹽的用工業鹽，該用米酒的用白酒，甚至用礦物酒精代替白酒。此外，用油、鹽、糖製藥，要因病而宜：高血脂病人，應注意少用動物油炮製的藥品；高血壓、心血管病病人應慎用鹽製藥品；糖尿病患者不宜服用糖製藥品。同時還應注意液體輔料的濃度、數量，固體輔料的使用次數、存放時間等，都會直接或間接地影響到中藥炮製的質量。如果只是象徵性地添加輔料，不僅起不到協同作用，還會造成相反的作用。
炒焦、炒炭法不衛生。中藥炮製中的炒法是將藥物置於炒鍋內，用中火加熱，翻炒至藥面焦黃。而炒炭法則是武火加熱，翻炒至藥面焦黑色，主要是針對一些原生藥材，以制其苦寒性。但是，原生藥材炒制至加熱冒煙，一般說溫度已超過200℃，這時含油脂的藥材其油脂迅速氧化，結果不僅破壞了油脂價值，而且產生大量有害物質。
用有毒有害物質炮製中藥。如用硫磺熏製藥材，硫磺有毒，屬於外用藥，用硫磺熏制過的中藥，或多或少地含有硫磺化合物，因此，不僅不衛生，還對人體有害；用明礬制中藥，明礬的主要成分為硫酸鉀鋁，含有大量鋁元素，而水解製藥又有一定濃度，製出的中藥便含有相當量的鋁元素，對人體有害；用灶心土或焦黃土炮製中藥，灶心土主要成分為硅酸鹽、鈣鹽及多種鹼性氧化物，而焦黃土經反覆使用後其性質與灶心土成分大體相同，在加熱的過程中，灶心土、焦黃土中的焦糊物質及一些重金屬也隨之「入侵」中藥材，對人體有害。
變質中藥處理後再使用。變質中藥主要指蟲蛀、發霉、變色、走油的中藥。當前，對變質的中藥，通常採取的方法是處理後再當正品使用，其主要方法有：一是對蟲蛀過的中藥進行篩、撿、烘、曬、除去蟲卵；二是對發霉的中藥，採取水洗、噴液、烘烤和暴曬除霉；三是對變色的中藥實行白酒淋、硫磺熏，使其變白轉色。對於變質的中藥，原則上都不應使用，特別是霉變、蟲蛀的中藥，不僅降低或失去了藥用價值，而且變質滋生了有毒有害物質，經處理後也不可能完全解決問題。
解決對策
要想從根本上解決上述問題，一是加強中藥炮製的管理，制定統一的炮製標準，納入《中華人民共和國藥品管理法》範疇管理，建立資質准入制度，由藥品監督部門定期進行檢查；二是增加投入，加大中藥炮製的硬件建設（如房屋、設備、電腦等），創立新工藝，向現代化邁進，提高科技含量，營造一個良好的外部環境；三是合理利用傳統的輔料，開發高分子有效成分的輔料，尋求更多的控釋、緩釋以及靶向制劑；四是加強中藥炮製專業隊伍的建設，在更新現有從業人員知識的同時，培養高層次專業技術人員，如碩士生、博士生等。提高中藥炮製人員的待遇，解決工作中的實際困難，搞好傳統的中藥炮製技術經驗的繼承，加速中藥炮製品科研成果向生產力轉化的進程，全方位地發掘中藥炮製學寶庫；五是加強對中藥炮製的宣傳，設置中藥炮製科研機構，在大專院校開設中藥炮製學專業，創辦中藥炮製刊物，普及中藥炮製知識，提高對中藥炮製工作的認識。
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