隨著中藥材生產的發展，中藥材引種馴化已越來越普遍。不同中藥材由於分佈地區不同，在它們長期生長過程中，逐步形成不同的生態型，因而具有其特有的生物學特性和形態特徵。在引種馴化時必須瞭解被引種對像生長發育所需條件和它原產地的自然條件，這樣才能在新引種地創造有利於引種對象的環境條件。中藥材在引種馴化過程中通常應注意以下幾個方面的問題：
1、日照的差異 在南藥北移或北藥南移的引種馴化中，由於緯度的差異，生長季日照長短髮生很大變化。北方緯度高，生長季日照時間較長，本屬長日照植物的中藥材，如紅花，從北方引種到南方栽培，則無法開花結籽。我省蘭溪曾發生從北方引種紅花顆粒無收的事件。原產北方的板藍根、白芷等如引種到南方栽培，日照縮短家屬發育，導致早熟。這些都給生產造成很大的損失。
2、溫度的差異 南藥北移或北藥南移，由於緯度和海拔高度的變化，溫度這個對植物生長有很大影響的環境因素已發生變化。南藥北移時，溫度由高變低，常由於冬季的嚴寒而凍死。北藥南移時，溫度由涼變為酷熱，常因夏天的高溫而死亡。在同一緯度，高海拔的溫度較低海拔的低。川芎從四川引種至廣西雖然產量尚算穩定，但因夏秋高溫，無法留種。
3、土壤和空氣濕度的差異 許多中藥材長期適應在林下生長，要求土壤和空氣具有較大的濕度，如許多姜科、天南星科植物，都要求陰濕環境，而山豆根則生長在乾旱的石縫中。
4、土壤性質的差異 土壤性質的差異有含鹽量、物理性狀和肥力等差異，但主要是酸鹼度的差異。如山東沿海產的北沙參引種到廣西南部栽培，根部發育不良或生長十分緩慢。除氣候的原因外，廣西南部酸性或強酸性的土壤不適於其生長。
以上幾種主要生態條件的差異，都分別給引種馴化造成困難，差異越大，難度越大。一般來講，地理距離越近，生態條件總體差異越小。因此，在引種時應盡量避免生態條件差異太大，然後採取相應的栽培技術，中藥材就能逐步適應新的生長環境，達到引種馴化的目的。
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