當前人工伺養的藥用動物，多為野生的和半馴化的動物，不能生搬硬套家畜、家禽等已有很高馴化程度的動物那種飼養方式和方法，必須走出一條適應藥用動物生物學規律的新路子。所以，應用生態學的研究在藥用動物飼養上非常重要，其中種群生態學和系統生態學的理論更有指導意義。因為人類要想得到比野生狀態下更多的產品，必須實行密集生產，這樣能使動物的密度比野外大許多倍；動物群的組成與結構，年齡比例和性別比例都要發生很大的變化，這種新的比例關係是為獲取優質高產的動物藥產品而在人類有計劃的安排下形成的。另外，動物生存的環境，如氣候調節、食物供應、場捨佈局、污物清除等，都是在人工控制下進行。這樣，就使人工養殖的藥用動物產生了新的種內、外生態關係，並在繁殖、生長發育和動物藥生產上，顯示出新的生產潛力。
一、食物鏈基本理論及其對藥用動物飼養業的指導意義
地球上的能源都是直接或間接來源於太陽能，綠色植物通過光合作用，可以將日光能轉變為化學能而貯存於體內，植物可以被草食動物所食用，草食動物又可被肉食動物所食用，於是，基於營養的關係，而將環境中的各種生物聯繫起來，形成鏈索狀關係，稱為「食物鏈」。例如：藻類一甲殼類—海馬—兇猛魚類；馬尾鬆一鬆毛蟲一蜈蚣。研究藥用動物食物鏈的組成及其量的調節，具有較大的經濟價值。如對珍貴藥用動物的種群保護和復壯，就必須瞭解該動物的生存環境中動物和植物的關係，動物在食物鏈上的前一環節（食物）和後一環節（天敵）的數量及其發展趨勢，才能知道所要保護動物的種群是將要得到發展或是走向滅絕。
在生態系統中，所有的機體，為了維持生命和繁衍後代，都需要攝取營養物質和能量，物質和能量的移動，是在食物鏈上逐級傳遞的。食物鏈上的每一個環節即為一個「營養級」，也叫「營養層次」。在各營養級中，第一營養級的數量最大，生產率最高，而後依次遞減，形成了各營養級之間的塔形關係，稱為「食物塔」。各塔級之間的數量比例關係大體為10：1，即生態學上著名的「數量金字塔定律」。從我國藥用動物飼養業現有水平的實際情況出發，上述幾個概念，在實際飼養工作中，都具有非常重要的指導意義。這些概念可以引導我們去研究藥用動物所在食物鏈中各個環節上物質和能量流動的數量變化；並進一步研究在對藥用動物種群保護和發展上如何有效地施加影響，在人工飼養上指導我們有計劃地準備飼料種類和數量，清除敵害；科學地安排動物群的性別和年齡比例，並分群飼養，使動物藥產量穩定地增長，以最小的飼養成本換取最大的生產價值。
二、根據食性研究藥用動物的飼料組成和供應
各種藥用動物都有它的特殊食性。在食物範圍上有廣食性、狹食性之分；在食物性質上有肉食性、草食性和雜食性之分。人工飼養工作必須在充分瞭解動物食性的基礎上，根據其營養要求，對食物供應、加工調製、飼養工具配備和飼養制度的建立等，進行全面地研究，才能保證藥用動物在家養條件下的生存。我國廣大勞動人民在這方面已經積累了豐富的經驗，如三大蟲類（蜜蜂、家蠶、紫膠蟲）的飼養；淡水魚類（青、草、鰱、鳙、鯉、鯽、鰉等）的飼養；禽類（鴿、雞、鴨、鵝類）的飼養和草食獸（兔、馬、牛、羊等）、雜食獸（貓、狗）的飼養等。近年來，野生動物的養殖範圍不斷擴大，其中也包括藥用動物飼養業的發展。
藥用動物的食性不是一成不變的。很多藥用動物在野生狀態下，其食性在不同季節，不同生長發育階段，有明顯的變化。認識動物食性的相對性，掌握食性的可變範圍，對藥用動物的飼養工作很有必要。如植食性的土鱉蟲，適當地搭配一些動物性食物，可以提高其生長發育速度；哈士蟆蝌蚪，增加一些動物性餌料，可以促使其提前變態，縮短飼養期；家禽在補充動物性飼料後，可以明顯提高產卵能力，種公畜在配種期補充動物性飼料，可以提高配種能力，改善****質量，另一方面，肉食性動物在飼料中適當增加植物性飼料，可以補充維生素及其微量元素的不足，保持旺盛的食慾。大量的事實證明，動物的食性在人工訓練下，可以在一定範圍內改變，通過改變其食性，可擴大其食物範圍，開闢飼料來源，促進動物更好的生長發育。
根據野生動物在食性上的特異性和相對性，在人工養殖時主要應以動物營養的基本要求來考慮其飼料組成、配比，並根據其攝食方式研究飼料的加工形式和飼喂方法，在飼養實踐中不斷地研究改進，最後，即會獲得最佳的飼料組合。
三、根據藥用動物的行為研究飼養管理方式
通過食物鏈的研究，不但可以瞭解到各種動物之間的食物聯繫，而且也可以進一步瞭解各種動物間的行為關係。行為學的內容很廣泛，如動物的季節活動和晝夜活動規律；爭奪佔領區、居住地、食物和配偶上的種內、外鬥爭；動物的社會性活動方式（個體、群體……）以及各種動物對環境的適應能力等。這些，對藥用動物飼養方式的選擇和飼養方法的運用都有很重要的指導作用。
藥用動物的飼養管理方式大體上可分為散放飼養和控制飼養兩大類：
1、散放飼養：散放飼養是我國多年來沿用的飼養方式，特別是個體飼養業者多採用。這種飼養方式又可分兩種類型：
A、全散放型。這種類型要求有較大的區域範圍，分佈密度較小，但由於總分佈面積大，總生產量也較大，投入的人工、物力少，成本低，動物基本上仍處於野生狀態，故又稱為「自然散養」。這種類型要求以本地區固有的或從外地引入的重要藥用動物為發展對像；在本散養區內培育成優勢種，並具有很大的種群生產力；散養區內的地勢、氣候、植被以及動物群落組成條件有利於本種動物的發展。氣候適宜，食物豐富，沒有限制種群數量發展的敵害；具有限制本種動物水平擴散的天然屏障，把動物的活動範圍，局限在一定的面積和區域之內。
B、半散放型。這種飼養類型比全散放型活動範圍小，養殖密度大，在人力、物力上要有適當的投資，單產比全散放型高，這種飼養類型要求在藥用動物水平擴散的天然屏障基礎上，配合以人工隔離措施。如電牧攔、鐵絲網、土木結構圍牆、水溝等，將動物限制在一定的半散放區範圍內活動。在動物採食天然食料的基礎上，適當補充人工食料。在一般情況下，僅是補充精料、食鹽和飲水。有計劃地採取措施，改善動物生活環境，清除敵害，保證藥用動物正常的繁殖和生長發育。
2、控制飼養：控制飼養也可簡稱為「精養」。這種方式是將動物基本上置於人工環境下，佔地面積小，飼養密度大，勞動投資較多，但是單產較高。如圈養（茸鹿、麝）、籠養（靈貓、鵪鶉）、池養（龜、鱉）、箱養（蜜蜂）、室養（家蠶）等。它對自然環境的氣候變化和飼料豐欠，可因人工補充而具有更大的獨立性，隨著現代科學技術的進步，生產能力在不斷地飛速發展。從飼養密度和技術水平上又可分為兩種類型：
A半密集飼養型。這種類型基本上包括了中國目前大多數的藥用動物場，是以人工操作為基礎對動物進行馴養和半馴養。這種飼養類型，在中國人民群眾中有著雄厚的基礎和傳統的習慣，同時也適合我國當前的經濟水平。
B高密度飼養型。這種類型的特點是單位面積內個體數量很大；與生產有關係的環境條件穩定在最佳狀態；飼料、飲水供應及污物清掃等生產過程達到自動化；動物個體生長速度加快，生長期明顯縮短；產品質量與產量大幅度地提高，飼養消耗減少，生產成本降低。這種類型中最突出的是養禽業，包括鵪鶉、烏雞等藥用禽類在內。
在制定飼養制度方面，要根據各種動物的季節活動和晝夜活動規律來確定。動物在野生狀態下繁殖，生長發育、蛻皮、換毛和休眠等週期性季節活動規律，是劃分每年生產期的基本依據；動物在野生狀態下的攝食、飲水、排泄等週期性晝夜活動規律，是建立每天飼喂制度的依據，另外，制定飼養管理制度時，還應考慮人的活動規律，譬如，藥用動物在野生狀態下，多為夜出性活動或晨昏性活動，而人的社會性活動則是白天進行的。所以，在制定每天的飼喂制度時，適當改變飼喂時間是完全可以做到並有利於生產工作的。
選擇好飼養方式和制定了恰當的飼養制度之後，在具體的飼養管理技術上，也必須針對不同種的動物進行全面研究。根據各種藥用動物養殖中存在的問題集中討論以下三點。
第一，是防逃，無論是散放飼養或控制飼養都要防逃。散放飼養主要由於生活條件優於相鄰環境，而主動吸引動物居於本區域內一般不易逃失；控制飼養由於密度大；動物易逃失主要依靠人工屏障控制，水生動物可用陸地為屏，陸生動物可以水為障。大型獸類用圍牆鐵柵控制。飛行鳥類用籠網控制。目前最難解決的是既能在水中活動，又能在陸地活動的一些小型藥用動物如蛤蚧（爬行動物）、哈士蟆（兩棲動物）等。目前蛤蚧採用了壘沙法，哈士蟆採用尼龍細網法、電圍欄法都有一定效果，但在生產上推廣應用成本仍屬過高，效果不理想，要解決好這個問題，還應深入研究。例如從垂直攀附能力來看，幼年的哈士膜和蛤蚧高於成年，可否按不同發育階段，用不同性質和不同造價的圍牆，進行分群隔離，由於隔離範圍小造價相對降低。又如目前國外已有利用蛇類看守糧庫和貴重物品庫，以防鼠害；利用魚類懼怕白色的特性，而在捕撈上形成「白板趕魚法」等解決動物逃失的經驗，都可參考應用。
第二，疾病防治，是從管理技術角度談疾病防治。「以防為主」的方針，在藥用動物飼養上尤為重要。因為這些動物多為小型動物，一個個單獨地治療很困難，用藥物治療在成本也很不經濟，就是比較大型的藥用動物，如鹿、麝等野性很強，人工強行捕捉用藥時，往往會造成病情惡化，加速死亡。野生動物自愈能力較強，應當加強護理工作，並根據藥用動物不同種類、年齡、生長發育階段，可將適量的藥物投放到飲水、食料中達到治療的目的。
根據上述情況，為了防止疫病的發生，首先要保持環境衛生，加強管理工作，採用消毒、隔離和預防接種三項措施。
消毒的目的就是防止疫病發生，消滅病原微生物，因此要對各種動物生活現場、設備、使用工具等選用適當的藥物，採用不同的消毒方法進行定期消毒。對工作人員或參觀人員進入養殖室也要嚴格消毒。
隔離，就是要嚴格劃分飼養區，合理佈局。飼養員要細心檢查，發現有個別動物發病立即拿出群外。普通病者可隔離飼養，以待其痊癒。診斷確定為傳染病者，均應立即火化或遠距離深埋。污染的飼草、糞便等要在適當的地方堆積發酵，做到消滅病源。
預防接種是防止傳染病發生的有效措施，不同種類的動物，應用不同種類的苗預防不同的疾病。預防接種方法很多，如注射法、刺種法、口服法、噴霧法等，要根據實際情況，正確選擇運用，定期接種。
第三，防止自殘。藥用動物的自殘現象，表現為甲動物嚼食乙動物，或通過爭鬥使一方或雙方致殘。這些現象不僅表現在肉食動物中，草食動物也同樣出現。產生上述現象的原因是非常複雜的，如居住空間不足；食物和飲水的缺乏或質量不佳：環境不夠安靜；外激素的干擾以及性活動期體內的生理變化等。
通過加強飼養管理措施，動物的自殘現象是可以防止和減輕的。群飼動物要掌握密度適當，防止飢餓（如藥用蟲類）；肉食獸類要防止產後食仔（如靈貓）；藥用蛇類主要是成年期出現自殘，宜於分養；哈士蟆的自殘現象多出現於蝌蚪期，要適當投給動物性飼料；烏雞、野雞（環頸雉）等爭鬥多因佔領區引起，草食獸類的爭鬥多因爭偶而發生。這些可以通過科學的飼養管理加以控制。
四、動物飼養新技術的發展和應用
目前動物飼養科學發展很快，很多新的飼養技術不斷被採用，在提高動物的繁殖數量加快生長速度、提高產品質量與數量等方面，都起到顯著作用。下面從氣候、營養、飲水等方面做簡單敘述：
1、氣候：動物的生產期與植物一樣受到自然氣候的密切影響，為了獲取更多更好的動物產品，延長生產期是一種有效的措施。如人工補充光照、溫度和濕度都能達到預期目的。在生產和研究上有的採用「單因子強化法」（即單獨增加光照、溫度或濕度等一種因素，其他都與自然環境一樣），有的採用人工氣候綜合強化法（如人工氣候室、氣候棚捨等），根據動物不同階段的生理要求，給予穩定的最佳氣候條件。
2、營養：在現代動物飼養學的研究中，對許多種動物的飼料組成、營養配比都已形成完整的設計，並在生產實踐中經過驗證行之有效。過去，在保證動物的維生素供應上。需要每日投給大量的青飼料，而現在用多種維生素添加劑；在營養供應方面，以某些氨、基酸做為營養添加劑，對改進動物毛絨、肉蛋質量，以及各種動物藥產品質量具有明顯效果。
3、給水：在動物飼養中，給水的時間、次數、質量等對動物各種生理過程有直接影響，而且通過給水也能攝取維生素、礦物質及各種微量元素。生產實踐證明，天然水的成分、對很多動物藥的質量有明顯影響，是地道藥材形成的重要因素。所以給水和飼料供應一樣。也是人類影響動物的一種手段。從動物對水分的攝取來看，以通過採食青綠多汁的新鮮飼料而吸收水分（結合水）和通過對營養成分的分解而同時獲取水分（結晶水）最為理想。目前磁化水對促進動物的消化機能、生長發育，甚至對某些疾病的治療等方面的研究，已經出現可喜的苗頭。
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