甘草貯藏一般為外包麻布的壓縮打包件，每件50公斤，貯於乾燥、通風處，商品安全含水量12%~14%。甘草倉庫害蟲有咖啡豆象、家茸天牛、四星栗天牛等十多種，充氮氣或二氧化碳514小時，成 蟲及幼蟲可全部死亡，甘草內質無明顯變化。
甘草易霉變，若空氣濕度過大，甘草表面易發生霉斑或白色和綠色菌絲，可採取以下措施防治：含水量確保14%以下，環境相對濕度控制在80%以下，包裝密封良好，採用堆位和賬去濕。化學熏蒸用10000：1比例的蓽澄茄揮發油密封熏蒸6天，其黴菌含量會大為減少。
甘草的貯藏期限不宜過長，有人對烏拉爾甘草在不同貯存期間進行了研究，發現貯存時間對甘草甙含量變化有直接影響，隨存放時間的延長而遞減，存放1年的為5.12%，2年的為4.24%，3 年的為3.08%。可見，甘草存放時間愈長，藥效成分損失愈大，因此，甘草產品要隨收隨賣，不要貯存時間過長。
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