從中西醫的區別來看，中醫治人，西醫治病；中醫進行系統的機理調節，而西醫是器官修理；中醫先經驗、再臨床、而後研究，西醫則是先有理論基礎、再臨床、而後發展藥物；中醫更宏觀，西醫更微觀；中醫是多維、集成思維，而西醫是點式、線性思維；中醫遵循個性差異原則，西醫則是普適性；中藥常為復方，西藥則注重有效成分；中醫是通過內部調節，西醫則是進行外部干涉；中醫講循序漸進，西醫追求快速反應；中醫在人身上實踐後，運用到更多人，西醫則是在動物實驗基礎上再給人使用。
中西醫應該相互學習和借鑒，在競爭中共存，研究方法上不斷進步，從技術和文化兩個層面加強融合。
因此，對中醫藥的創新研究方法，一是傳承精髓不動搖，去粗取精不保守。在創新路徑方面，要通過思維跨越，創新方式，突破關鍵技術，改革工藝，從而發明革新。二是高位嫁接，引進、消化、吸收、再創新。中醫藥要與其他學科交叉融合，引進系統論和控制論、生物工程、信息化、分子生物學、現代診斷方法，融合現代人才和技術，達到創新方法的目的。三是開發特色中醫藥產品。包括對經典方劑保護和二次開發，研發以中醫理論為基礎的醫療器械，開展未病、老年、特殊群體、休閒保健等方面的健康服務。四是建設中醫藥文化。
我認為，中醫藥方法學的進步必將帶來重大突破。
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