百日咳是由百日咳嗜血桿菌引起的呼吸道傳染病。中醫稱頓咳、頓嗆、疫咳等。病程可達2～3個月以上。「最難速愈，必待百日後可痊」（明·沈時譽《治驗·頓嗽》）。
其感在肺 其病在肝
百日咳系感受時邪為患，雖肺先受邪而證多系肝。首先從發病季節看，百日咳多在春季三、四月發病。《素問·咳論》曰：「五臟六腑皆令人咳，非獨肺也……五臟各以其時受病，非其時各傳以與之……乘春則肝先受之。」發病季節正應肝氣。其臨床見症頗具特點，百日咳初感，始見微熱惡風，咳嗽流涕，繼則咳嗽加劇，「從少腹下逆上而咳，連咳數十聲，少住又作，甚或咳發必嘔，牽制兩脅」（《本草綱目拾遺》）；陣咳發作時，兩手握拳隨咳而攣動不止，弓背彎腰，滿面紅赤，頸脈怒張，涕淚交迸，嘔吐痰涎、胃內容物與膽汁，最後發出一雞鳴樣回吼聲，其咳方暫止，甚者抽風昏厥，窒息氣閉。「咳之至久，面目浮腫，或目如拳傷，或咳血，或鼻衄」（《治驗·頓嗽》）。陣咳之後身疲無力，蹲之久不能立，較大兒童自訴脅腹作痛。
握拳攣動、弓背彎腰、抽風昏厥皆屬風動之狀，「諸風掉眩，皆屬於肝」（《素問·至真要大論》）。「肝氣通於目」（《靈樞·脈度》），「肝藏血」（《素問·調經論》），肝氣上迫，肝液上湧則為淚；肝血上逆則面赤而頸脈怒張；肝火傷及目絡則目睛充血；肝火灼傷肺絡則咯血、鼻衄；咳引兩脅作痛為肝咳之征。《素問·咳論》曰：「肝咳之狀，咳則兩脅下痛……肝咳不已，則膽受之，膽咳之狀，咳嘔膽汁。」肝氣犯胃，胃氣上逆則為嘔，肝病及膽則嘔吐膽汁。百日咳發作的另一個特點是，午後至半夜為重，半夜後至午前發作明顯減少，這與《素問·髒氣法時論》：「肝病者，平旦慧，下晡甚，夜半靜」相符。百日咳多在三、四月起病，而痊癒則多在六、七月，這也與「病在肝，愈於夏」（《素問·髒氣法時論》）相一致。以上可以看出百日咳與肝密切相關。
木火刑金 風痰相搏
肺屬金居於上焦，為陽中之陰髒，而主肅降；肝屬木位於下焦，為陰中之陽髒。「肝足厥陰之脈……屬肝，絡膽，上貫膈……連目系……其支者，復從肝，別貫膈，上注肺」（《靈樞·經脈》）。肝氣升發而主疏洩，在生理上，肺氣的肅降要靠肝氣的疏洩，肺氣的肅降正常也有助於肝氣的條達。在病理上則相互影響，若肝郁化火，循經上行，灼傷肺絡，則可出現脅痛、易怒、咳逆、咯血等肝火犯肺（木火刑金）之證；反之，肺失肅降，燥熱下行，亦可影響到肝，則肝失條達，在咳嗽的同時而見胸脅脹滿引痛、頭暈頭痛、面紅目赤等。王肯堂曰：「火乘肺者，咳嗽上壅，涕唾出血，甚者七竅出血」（《證治準繩》）。小兒肝常有餘，患病極易化火生風，頓咳初感在肺，繼則化熱化燥，引動有餘之肝火，肝火循經犯肺，火灼肺金，煉液成痰；肝熱則生風，風痰相搏，痰阻氣機，氣機不利，則痙咳劇作。陣咳之後，痰與膽汁嘔出，則肝火得洩，氣機暫暢，故咳休止。肝火再逆，風痰再動，則痙咳再作，這就形成了百日咳之典型見症。這一病機概括為：木火刑金，風痰相搏；其咳在肺，其制在肝。
治從肝論 鎮肝止咳
「治病必求於本」（《素問·陰陽應像大論》）。本病初感，其治法與風邪犯肺同，所謂「時醫到此，束手無策」（《治驗·頓嗽》），是指痙攣性咳嗽而言。對於百日咳痙咳期的治療，在前人的基礎上，根據自己的上述理論見解和臨床體會，提出了「鎮肝止咳」的治法，創製了鎮肝止咳湯一方：柴胡6克，生白芍10克，代赭石10克，青黛1克，炒殭蠶6克，膽南星3克，甘草3克。為3～5歲用量，可隨年齡增減。日1劑，水煎，分2～3次服。
方中柴胡疏肝以散肝熱；白芍平肝緩急；赭石重鎮肝逆；青黛清瀉肝火；殭蠶為治風痰之聖藥，化痰息風止痙；膽南星清熱化痰；甘草瀉火以調和諸藥。諸藥配伍，共奏清肝瀉火，平肝降逆，化痰息風，鎮肝止咳之效。熱重者，加黃芩；嘔吐者，加姜半夏；目睛充血者，加黑山梔、赤芍、丹皮；鼻衄、咯血者，加白茅根；咳久而出現陰虛者，加沙參、麥冬；面目浮腫而出現脾虛者，加白朮、茯苓。
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