經絡學說是中醫學的重要理論基礎，但又一直不能為現代科學所證實，所以否定經絡存在進而認為中醫學不科學者大有人在。筆者在此暫不討論經絡之有無，僅對否定者的思想方法做一評析。
否定者認為：經絡無法在解剖中發現，即使電子顯微鏡也無法發現，所以沒有。筆者想問：第一，屍體沒有呼吸、心跳和血液循環，無法全面反映活人身上的問題。屍體中沒有氣血運行，當然難以找到氣血運行的通路——經絡了。第二，電子顯微鏡沒有發現不等於沒有。在牛頓沒有發現萬有引力之前，宇宙中就沒有萬有引力嗎？在人類沒有發明檢測電磁場的儀器之前，宇宙中就不存在電磁場嗎？在西方醫學沒有發現胸腺之前，人體就沒有胸腺嗎？僅以解剖中暫時未發現就否定經絡存在不符合科學精神。幾十年來，中國的經絡研究已經發現、證實了一些經絡現象和經脈線上的物質基礎。既然講科學，首先要尊重事實，否定者為什麼對這些實驗結果視而不見呢？
否定者認為：西方醫學沒有發現經絡就說明中醫學不科學。那麼：什麼是科學？怎樣認識科學？不同學者對科學有不同的定義，但共同點是對自然、社會和思維規律認識的知識體系。但是，現代科學對於這些規律只是認識了很少一部分，是否完全正確尚未可知，所以很多領域都有不同學派的爭鳴。
而人體是一個非常複雜的系統，西方醫學迄今為止對很多疾病的根源都沒有徹底認清，也就無法快速有效地治癒。中醫學理論有著與西方近現代科學不同的建構和表達模式，它凝聚了中國古人的智慧，其臨床實踐經歷了兩千多年的檢驗。現代科學暫時沒有完全解釋，不等於永遠不能解釋，不等於中醫學就不科學；只能說中醫學和西方生物學、醫學對人體的研究角度、方法不同，但最終目的都是為了揭示人體的奧秘，更有效地治病救人，而這種不同本身恰恰可以成為科學發展的動力。
在人類科學史上，科學觀點、科學方法不斷被完善、修正甚至否定。20世紀晚期以來，西方科學逐漸對還原論的思維方式做出反思，而中醫學理論中蘊含的辯證、整體、系統的思維方式正在為有識之士所重視。僅就經絡學說而言，就有研究者認為：經絡研究很可能孕育著生命科學的革命和科學方法論的突破。這是我們中華民族對人類科學事業的貢獻，我們應為之自豪並大力宣揚；而簡單地用西方醫學的標準評價中醫進而妄自菲薄是西方中心論不自覺的表現，這本身又是一種錯誤的思想方法。
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