薏苡仁是治病之良藥，具有除風濕、止痺痛、利關節、緩拘攣、健脾去濕、止帶止瀉之功。
薏苡仁治療濕滯絡脈肌膚之痺痛，如《本經》記載「苡仁主筋急拘攣，不可屈伸，久風濕痺」。《金匱要略》用薏苡仁配麻黃、杏仁、甘草組成麻杏苡甘湯用於患 「風濕一身盡痛」者。薏苡仁常用於胸痺止痛，《金匱要略》云：「胸痺緩急者，薏苡附子散主之。」即以薏苡仁配附子，助陽化濕，緩急止痛；用於寒濕胸痺，也常與薤白、蒼朮、乾薑、檀香、木香等配伍。
薏苡仁善去濕而有清熱解毒排膿之功，治療肺癰可單用，如《濟生方》即單用薏苡仁治療肺癰的記載；千金葦莖湯中用薏苡仁、冬瓜仁、桃仁治肺癰成膿確有療效。薏苡仁去濕善治濕溫病，《溫病條辨》雲三仁湯治「頭痛惡寒，身重疼痛，舌白不渴」者，方中即以薏苡仁利濕熱，疏導下焦，配杏仁、厚樸、白蔻仁、半夏、滑石等品治濕溫初起濕重熱輕之證。
薏苡仁為健脾去濕之良藥，婦人脾虛帶下最為常用，常與黨參、焦白朮、山藥、扁豆等配伍應用。薏苡仁健脾也善治脾虛洩瀉，如治療脾虛洩瀉的良方參苓白朮散，即是由薏苡仁配伍人參、茯苓、白朮、陳皮、桔梗、扁豆等組成。
《別錄》謂薏苡仁「利腸胃，消水腫，令人能食」。近代醫家也常用薏苡仁作為利尿消腫之要藥。如白菜苡仁湯可用生薏苡仁30~50克，白菜500克，共煎湯食之，具有健脾去濕，清熱利尿作用，常用於急性腎炎浮腫尿少者。治療濕熱水腫之證，臨床常配伍赤小豆、澤瀉、茯苓皮、大腹皮、車前子等，每可收效。
薏苡仁也是食補療法的要物，含有蛋白質、澱粉、維生素等，營養豐富，效用廣泛。《本草綱目》載有藥糕治病，用薏苡仁與米粉、麥粉或豆粉做成糕食用，功能健脾養胃，益氣和中，主治脾胃虛弱，症見食少腹脹，納呆，面黃肌瘦，便溏洩瀉者，可作點心常服。《聖濟總錄》記載用薏苡仁餅主治虛勞證；《醫學衷中參西錄》取生薏苡仁、生山藥配製成「珠玉二寶粥」，對老年病、久病、胃氣不足者均適用。筆者在臨床也常用薏苡仁、大米、小米、紅棗煮粥食之，確有健脾和胃，促進康復之效果。
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