無論專業廠家或家庭配製藥酒，在製作藥酒前，都要做好以下幾項準備工作：
1)嚴格衛生要求，保持場所清潔。配製藥酒的場所要做到「三無」，即無灰塵、無沉積、無污染。同時配製人員亦要保持清潔，閒雜人等一律不准進入場地。
2)要根據自身生產條件製作適宜藥酒。每一種藥酒，都有不同的配方和製作工藝要求，所以不是每個專業廠家，更不是每個家庭可以配製的，要根據自身生產條件，配製技術而定。如家庭自製藥酒，首先要選擇適合家庭製作的藥酒配方，並不是所有藥酒配方都適宜家庭製作，例如有毒副作用的中藥材需經炮製後才能使用；如果對藥性、劑量不甚清楚，又不懂藥酒配製常識，則需請教中醫師、中藥師，切忌盲目配製飲用藥酒。
3)配製藥酒的酒和中藥材，要選取正宗成品，切忌用假酒偽藥，以免造成不良後果，妨礙健康或影響治療效果。配製藥酒，一般宜用優質高度白酒（或中低度白酒或其他酒類，按需要而定）。但是，現在市售的白酒中不時會有假冒偽劣產品出現，應當引起注意，如假酒中的甲醇對人體危害相當大。因此，選用白酒配製藥酒，一定要辨清真偽，切忌用假酒配製。按配方選用中藥，一定要選用上等正宗中藥材．切忌用假冒偽劣藥材；對於集市貿易出售的中藥材，要先認準後再購，不可輕信商販之言。即使自行採購的鮮藥、生藥往往還需要先按規定要求加工炮製。對於來源於民間驗方中的中藥，首先要弄清其品名、真假，要防止同名異物而造成用藥錯誤。
4)準備好基質用酒。目前用於配製藥酒的酒類，除白酒外，還有醫用酒精、黃酒、葡萄酒、米酒和果露酒等多種，具體選用何種酒，要按配方需要和疾病而定。
5)制備藥酒的中藥材，事先都要切成薄片，或搗碎成粗顆粒狀。凡堅硬的皮、根、莖等植物藥材可切成3mm厚的薄片，草質莖、根可切成3cm長碎段，種子類藥材可以用棒擊碎。同時在配製前，要將加工後的藥材洗淨（防止污染雜質）、晾曬。
6)要準備好配製藥酒用的容器和加工器材及封容器口等一切必備材料。容器大小要按配製量而定。
7)要熟悉和掌握配製藥酒常識及製作工藝技術。
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