毒性、麻醉性中藥材
應按不同性質使用相應的包裝材料，採用特殊包裝，有明顯的規定標記，加封，以引起貯運各個環節中工作人員的注意。
貴細中藥材
應使用內包裝和特製的包裝箱作外包裝進行雙重包裝，以免在貯運過程中因裝卸碰撞等引起外包裝破損後貴細藥材遭受損失和污染。在外包裝上不宜標明品名，以防被盜。對貴重中藥材，也可進行特殊的、精緻的精品包裝，既可保證質量，又能提高商品價值。精品包裝規格一般較小，在小包裝外再進行精美的外包裝，如珍珠粉、人參、西洋參、天麻、西紅花、羚羊角等。
鮮用藥材
因其含水量高，易霉變、腐爛，在貯運過程中要採用特殊包裝和保鮮措施，既要保持一定的濕度，避免過度乾燥而枯死，又要防止過於潮濕而霉爛，污染其他藥材。
易霉變、易泛油、易蟲蛀中藥材
隨著包裝技術的進步，對於易霉變、易泛油、易蟲蛀的中藥材亦可採用真空包裝；對於花類藥材如金銀花、菊花等以及色澤、成分不穩定，易氧化藥材亦可採用充氣包裝，方法是將藥材密封並抽出袋中空氣後，再充入惰性氣體如氮氣、二氧化碳等。
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