隨著教育規模的擴大和人們對中醫需求的增加，中醫優質醫療資源相對而言越來越緊缺，群眾看病排長隊、掛號難現象時有發生，同時也影響了中醫院校學生臨床實習實踐。為適應這種需求，南京中醫藥大學積極改革校醫院，在為教職工提供醫療服務的同時，面向社會，拓展服務，既為群眾提供了高水平的中醫診療服務，也成為學生身邊的實踐基地，探索出一條開辦校醫院的新模式。
依托學校優質師資資源，建立一支臨床帶教隊伍。校醫院以專家教授、主任醫師為主體，外聘一定數量有教學經驗和臨床實踐診療水平的人員為補充，兼專職相結合，由250人組成的臨床教學師資隊伍，其中有1/3為退休人員，他們定時定點輪流在校醫院臨床帶教。30年來為臨床帶教博士碩士本科生5萬多人次，提供診療800多萬人次，小醫院、大服務，充分發揮校醫院的特色和優勢，形成教學、醫療、科研三位一體新的校醫院模式。
以優勢建特色專科，既面向患者又面向教學。以臨床為主體，以教學為主導，以強化臨床實踐為核心，充分發揮名師、名醫、專科、專病特色優勢。以病統論，以論統案，以案統治，強化學生臨床實踐能力培養，形成先繼承後創新的校醫院臨床教學模式。30年實踐證明，經過校醫院臨床教學實踐，學生們中醫基本功紮實、發展潛力較大，具有銳意創新的主觀要求與客觀能力，受到學生和用人單位的好評，社會就業率98%以上。
校醫院在臨床教學實踐中，堅持以學生為中心，發揚學術民主。結合臨床實際，採取問題式教學方法，讓學生把學到的理論與實踐結合討論問題，提高了他們分析問題解決問題能力。在學習過程中，根據不同的教學內容，採用啟髮式、討論式、研究式、對比式、立案式等方法，使學生在臨床實踐中不知不覺地掌握了課堂教學內容。針對學生們在學習過程中存在的學習障礙，如現代科學（包括現代醫學）與傳統醫學形成的時代反差，現代科學知識環境和語言表達方式與古代科學知識表達方式差異，現代思維方式與傳統醫學思維方式差異等等，帶教老師組織學生討論，合理解釋，提高了學生們對中醫學的認知和理解，鞏固了專業思想，培養他們熱愛中醫事業、熱愛自己的專業。
發揮名醫名師作用，培養優秀人才。充分利用學校為國醫大師和名師名醫在校醫院設立的工作室和名醫堂，如周仲瑛國醫大師、楊進、王燦輝、汪授傳等名師名醫在校醫院都有工作室。他們在看病的同時也帶教學生，很多在他們身邊學習的學生體會說，名師名醫堂是學生求學的殿堂，是實踐育人的課堂。知識服務於人民是我們精神財富。跟師學習找到精神家園，是我們今後走上工作崗位做人做事的行為榜樣，對中醫事業要熱愛，對病人要有責任心，對人生要有平常心，才能登上中醫藥事業的高峰。
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