中醫藥科研的概念是什麼？應該是在以中醫藥理論和標準為指導下所從事的科學研究活動與取得的效果，從這個角度講，脫離了中醫藥理論為標準的科研都不能稱其為中醫藥科研。因此，從嚴格意義上說，我們目前所指稱的「中醫藥科研」已不是正宗中醫理論和標準所認可的中醫藥科研範疇。因為，中醫藥科研究的作用對象，其前提應該是，以中醫藥學科範疇內所認定的理論和標準所取得的成果，很明顯其現在所用的卻是西醫藥科研理論和標準，這種以一種科研理論和標準，來解釋另一種科研理論和標準認定的結果，即以西醫藥科研的理論和標準來解釋中醫科研理論和標準所認定的結果，其研究出來的成果只能是二者當中之一被另一方所同化，即要麼中醫藥科研理論和標準被西醫化，要麼西醫科研理論和標準被中醫化，只有這樣才具有令人信服的說服力。
而客觀現實是，中醫藥科研基本上是套用的「西醫」理論和標準。就當下而言，我們還沒有辦法，更不可能讓別人用中醫藥理論和標準來表述中醫藥研究成果的客觀效果，比如，我們說某項中醫藥科研成果能提高心陽的量，某項成果能補脾氣，使三級脾氣虛降為一級脾氣虛，某項成果能使實火轉化為虛火，如此籠統空乏的表述用來作為「科研」分析理論、列為客觀指標，就連我們自己都說不圓滿，更不要指望在現代科技界形成共認、共識了。
中醫要發展必須搞科研，搞科研我們又缺乏現代科技界共認、共識的中醫藥科研理論和標準，怎麼辦呢？就目前而言，唯一的辦法只有借助現代科技界人所共認、共識的所謂「西醫」科研理論和標準來衡量中醫藥的研究效果。我覺得這種「拿來」現象是中醫藥向現代化邁進時的必然，對中醫來講是好事而不是壞事，它至少表明中醫藥界與時俱進、渴望求變的心態，同時也暴露出中醫藥在向現代化邁進的進程中存在的一些問題——中醫藥科研理論和標準的缺失。
這種缺失給中醫藥發展帶來的損害是巨大的：一些科研成果，從中醫藥角度講，要麼理論分析乏力，生搬硬套；要麼自相矛盾，不能自圓其說；要麼只能「套用西醫」理論和標準，而這種「四不像」的成果，我們很多人倔強地認為是人家在「西化」我們，而「西化」我們的人卻鄙視地認為我們在套用其理論和標準。
如何使我們的理論、標準、觀念、主張得到現代科技界的認同？唯一的辦法就是我們必須創新性地與社會需求同步，在繼承傳統的同時，開創出有我們自己特色，並能在現代科技界產生共鳴的理論、標準、觀念、主張。有的中醫藥學者提出用中醫藥的思維方式和世界觀看世界，可以說這是目前最能保持住中醫藥理論根基和標準的一種創新設想。我覺得找出中西醫兩種醫學理論標準的結合點(比如自然辯證法思想)，也不失為創新出一種不同於兩種醫學理論和標準的新型中醫藥科研體系的思維方式。當然這點設想還遠遠不夠，創建一個新的中醫藥科研體系，是一個極其浩大的工程，牽涉的東西還很多很多，我們要走的路還很長很長，甚至還需要幾代人不懈努力。即便這樣，我們也必須應該具備這方面的憂患意識，必須立即投入到這項工作中去，否則，中醫藥科研就無法擺脫寄人籬下的尷尬境地，而沒有科研作支撐的中醫藥也就只能原地踏步，無法前進。
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