古代的計時，主要是根據太陽之升落、天色的明晦，而將一日分為不同的時段。「時」，指時段，有的是指瞬間現象，有的則較長，且一年四季晝夜的長短不一，故時域不等。「辰」，指十二辰，將一日分為十二等分，各辰時域相等，四季晝夜無別。《內經》認為時辰與臟腑有著密切的關係，每一臟腑之氣，都在一天中特定的時辰內，表現出相對的旺盛，從而影響人的生理和病理，也影響著對疾病的診斷和治療。由於《內經》理論體系具有以五臟為中心的特點，所以有關時段與內臟的關係，也往往以五臟為代表。這裡的五臟，實際是指五臟系統，它包括六腑、五體、諸竅等。因此，時辰與臟腑雖然有不同的配屬，但以五臟為中心的特點，卻是一致的，其配屬主要有以下幾種：
第一，五時段配屬五臟。即將一晝夜分為五個時段，各配屬一髒，其中有兩種配屬法。
首先，根據五臟所在部位及其功能特點，以上下腹背分別陰陽，並與晝夜陰陽時段相互聯繫而配屬。如《素問·命匱真言論》云：「平旦至日中，天之陽，陽中之陽也。日中至黃昏，天之陽，陽中之陰也。合夜至雞鳴，天之陰，陰中之陰也。雞鳴至平旦，天之陰，陰中之陽也。」所謂「合夜」，即「始夜」，天黑之始也。這種時段劃分，除黃昏到始夜外，其它都是相連貫的，即合夜→雞鳴→平旦→黃昏。由此可見，黃昏至合夜亦當為一個時段。這樣就把一晝夜分為五個時段，恰好與五臟相配。該篇接著說：「背為陽，陽中之陽，心也。背為陽，陽中之陰，肺也。腹為朋，陰中之陰，腎也。腹為陰，陰中之陽。肝也。腹為陰，陰中之至陰，脾也。」前四段分別與四髒相配甚明，雞鳴至平旦配肝，平旦至日中配心，日中至黃昏配肺，合夜至雞鳴配腎。脾為至陰，至者，到也，交也；從陽始交於陰，故稱至陰。黃昏至合夜正屬這樣一個時段，故與脾相配。
其次，根據五臟的五行屬性，分別與五個時段相配屬。如《素問·髒氣法時論》以五臟配五季。為肝主春，心主夏，脾主長夏，肺主秋，腎主冬。對五臟與晝夜時段相配的關係，是從五臟病在各自相配的時段其病情好轉而表現出來的，如「肝病者，平旦慧」，「心病者，日中慧」，「脾病者，日映慧」，「肺病者，下晡慧」，「腎病者，夜半慧」。這樣，它們的配屬關係是：平旦（木)配肝，日中(火)配心，日昳(土)配脾，下哺(金)配肺，夜半(水)配腎。
此種配屬法，是根據五行學說以五臟、五時、五行相關為標準，所以脾土在其所生肺金之前；而上述第一配屬法，則主要是按照陰陽學說，以五臟上下腹背陰陽為標準，因此，上焦胸背之肺臟，在於腹中脾臟之前。余髒配屬順序相同。這一差異，除反映出陰陽學說與五行學說兩者，雖然相互融合，但仍表露出結合併不十分緊密之外，更重要的是各自從不同的側面，部分地反映出脾臟主時的特殊性。
第二，四時段配屬五臟。即將一晝夜分為四個時段，分別配屬肝、心、肺、腎四髒，而將脾臟分散於各時段。又因脾臟是分散於四時段全部還是各時段一部，而有兩種說法。
一是脾臟分散於四時段全部，沒有自己單獨所配之時。《靈樞·順氣一日分為四時》篇云：「以一日分為四時，朝則為春，日中為夏，日入為秋．夜半為冬。」根據《素問·髒氣法時論》及《內經》其它多處記載，不難看出，朝配屬肝，日中配屬心，日入配屬肺，夜半配屬腎。《素問·玉機真髒論》云：「脾為孤髒，中央土以灌四傍。」脾為後天之本，對其它四髒起滋養作用；春、夏、秋、冬四季亦皆賴土氣之長養；四時脈象都當有胃氣，說明人體一時一刻不可離開脾土，四髒亦須臾不可無土氣。所以說脾臟沒有單獨所主之時，但四時段均有脾氣。《靈樞·九宮八風》篇記載五行與九方八時相配時，土數五居中央，不主時令，而其它六方各主四十六日，兩方各主四十五日，凡三百六十六日為一歲，也是認為脾不獨主一時。一年如此，一日中分四時，亦如此。
二是脾臟分散於四時段之末，各寄配每段五分之一。如《素問·太陰陽明論》云：「脾不主時何也？歧伯曰：脾者，土也，治中央，常以四時長四髒，各十八日寄治，不得獨主於時也。」人是一小天地，一晝夜亦是一年的縮影，在一晝夜中，說明脾臟分主四個時段末的各五分之一時間。因每季九十日，十八日則其五分之一，脾臟全年共佔七十二日，與其餘四髒所主之時的各七個二日，合為三百六十日整。此種四時段配屬五臟的方法，與上述五時段配屬五臟的基本區別，在於脾臟不獨主一個時段而分散於其它四時段之中。雖然如此，但是兩類配屬法的根本道理則是一致的，都是以「土以灌四傍」為根據的，不論脾主一時還是脾不主時，其中心意思都在於說明脾土具有生化之源、氣機轉運之樞兩重作用。
第三，十二辰配屬五臟。上述四時段、五時段的劃分，因其時域不等，不易掌握，而十二辰把一日分為十二等分，結合現代計時標準，每辰兩個小時，運用計算均較方便。早在《內經》時期，即有一日分為十二時段的記載，在漢武帝太初元年以後，便用十二地支來紀一日的十二時段，稱為十二辰。《內經》的十二時辰與臟腑配屬是在脾「不得獨主於時」、「寄旺於四季之末各十八日」的基礎上逐漸形成的，即寅卯（朝）與肝膽木氣相配，巳午（日中）與心小腸火氣相配，申酉（日入）與肺大腸金氣相配，亥子（夜半）與腎膀胱水氣相配，辰、戌、丑、未四個時辰與脾胃土氣相配。前四個時段，分別主兩個時辰，後者主四個時辰，凡十二時辰，合為一晝夜。
這種十二辰與臟腑配屬的關係，與上述《靈樞·順氣一日分為四時》篇時段劃分法一致，而更加精細；同時又補充入脾不主時的認識，但脾旺的時間，不是《素問·太陰陽明論》指出的占一年或一晝夜的五分之一，而是三分之一。這一配屬關係，為目前臨床所常用。
《內經》認為「人與天地相參也，與日月相應也」。天體不停息地運動，對包括人類在內的生物界具有廣泛而深刻的影響。這種影響，以具有明顯節律性的太陽、月亮和地球的運動最為突出。動植物以及人類，在有節律運動變化的環境中發生和演化，也正是在適應這種環境爭取生存的漫長過程中，形成了同步於太陽、月亮和地球運動的幾種不同節律週期。《內經》認為人體主要生命活動在於肝、心、脾、肺、腎五臟功能活動系統，而由於「天人相應」的關係，這五個系統也必然是「開放」的。因此，對於一年中四季、一天中四時寒熱溫涼陰陽消長的變化，人體也有不同的功能系統與之相通應，並產生相應的變化。
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