五運六氣理論反映了中醫學「天人相應」的整體觀念和「三因制宜」的辨治思想，尤其對複雜的臨床問題，具有相當的指導應用價值。《內經》早有「必先歲氣，無伐天和」之誡，以下介紹的二則病案，便充分體現了該理論的作用。
病案1
張某，男，50歲，2015年4月2日初診。咳喘反覆發作5年，再發1周，經抗炎解痙輸液治療無效來診。刻診：夜間12點以後咳甚，咽有異物感，痰白量少，咳則煩熱出汗，納可，大便調，舌暗紅，苔黃膩，脈細滑。
咳嗽發作於夜間12點以後為劇，符合「厥陰病欲解時」(從丑至卯上)，故予烏梅丸治之。烏梅30克，細辛3克，肉桂（後下）4克，黃連4，黃柏10克，當歸10克，黨參15克，川椒3克，乾薑9克，制附片5克，桑葉10克，菊花10克，殭蠶10克，桔梗5克，甘草5克。7劑水煎服。
二診（2015年4月9日）：夜間12點後咳嗽仍甚，且心情急躁，面部火熱，無法入睡，並感右脅疼痛，咳時煩熱，盜汗，咽有痰滯感，無噁心，納食可，舌暗紅，苔黃膩，脈細小弦。參考年運「二之氣」的運氣特點，決定改變處置思路：既遵循年運歲氣使以血府逐瘀湯，同時結合厥陰欲解時和少陰欲解時（子至寅上)遣用烏梅丸及黃連阿膠雞子黃湯法消息以觀。原烏梅丸方加黃芩10克，阿膠珠10克，白芍10克，炒柴胡6克，枳殼10克，生地10克，桃仁10克，紅花5克，桔梗6克，川芎6克，懷牛膝10克，炙甘草5克，浮小麥30克，大棗10克，雞子黃1個沖服。7劑水煎服。
三診（2015年4月16日）：夜間咳喘明顯減輕，且得安寐，煩躁，盜汗諸症亦緩，仍感咽有異物感，舌暗紅，苔薄，脈細小滑。再予原方加射干10克，7劑。
四診（2015年4月23日）：訴咳喘已得控制，咽部異物感亦消失，苔薄質淡紅，脈細靜。予原方加羊乳15克，7劑愈。
病案2
鄭某，男，53歲，2014年6月27日初診。訴氣短，活動後氣喘，鼻塞，無流涕，不咳嗽，口乾，盜汗，疲勞，來診前曾在南京某醫院經肺穿病理診斷為機化性肺炎，已口服潑尼松龍治療4月，現仍每日服3粒，舌暗紅，苔薄黃干，脈細。據證從益氣陰，化痰瘀，調陰陽治療，方選生脈散合當歸六黃湯意。黨參10克，麥冬10克，五味子5克，生熟地各15克，黃芪20克，炒當歸10克，川連3克，黃芩10克，蘇葉10克。7劑水煎服。
二診（2014年9月10日）：動則氣喘好轉，但自覺怕冷，腳心冰涼，盜汗，口乾苦，受涼易腹瀉，納可，二便正常，舌偏紅，苔黃剝，脈細小滑。據此時運氣特點予附子山萸湯合正陽湯。制附子6克，山萸肉10克，煨肉豆蔻10克，烏梅15克，木瓜10克，木香10克，丁香3克，炙甘草5克，大棗10克，生薑3片，黃柏10克，砂仁（後下）5克，當歸10克，白芍12克，川芎6克，桑白皮15克，玄參15克，白薇10克，旋覆花（包）6克，陳皮6克。7劑水煎服。
三診（2014年9月17日）：怕冷已除，口乾苦亦無，無腹瀉，寐差，夜半2點易醒，盜汗，胃納可，舌暗紅，苔薄，脈細滑。據證予以黃連阿膠雞子黃湯合當歸六黃湯。黃連3克，黃芩10克，阿膠珠10克，白芍12克，炙黃芪20克，炒當歸10克，生地15克，炒黃柏10克，五味子5克，百合15克，雞子黃1個沖服。14劑水煎服。
四診（2014年9月30日）：訴藥後盜汗消失，夜寐安寧。後又調治3月病情穩定，激素停服。
按：以上二則醫案都是在運用常規辨治乏效，參議運氣理論後方取得良好療效的。
案一初診時據「厥陰病欲解時」予烏梅丸方無效，因思及當下年運處於「二之氣」，此時「主氣，客氣」均為少陰君火，遵「必先歲氣，無伐天和」之訓，使以血府逐瘀湯解決少陰火，因患者還有「少陰欲解時」的時運特點，做到「謹候氣宜，無失病機」，復入黃連阿膠雞子黃湯，改變思路，既遵循年運歲氣，同時結合厥陰欲解時和少陰欲解時復合選方方獲成功，充分體現了「求其至者，氣至之時也，謹候其時，氣可與期，失時反候，五治不分，邪僻內生，工不能禁也」（《素問·六節藏象論》）的學術思想。
案二初診時按常規辨證予生脈散合當歸六黃湯治療後反應平平，二診時考慮2014為甲午年土運太過，9月份主氣客氣橫跨太陰濕土與陽明燥金，少陽相火，表現既有寒濕，又有陰虛內熱，在患者身上反映出來的症候也是寒熱兩重天，既有「怕冷，腳心冰涼，受涼易腹瀉」寒象，又有「盜汗，口乾苦，苔黃剝質偏紅」等火熱之兆，故改用主以歲土太過的附子山萸湯，又選水火寒熱之氣見於氣交的正陽湯合方，方使寒熱之候均解，後敘症「寐差，夜半2點易醒，盜汗」，符合「少陰欲解時」（子至寅上），故選用黃連阿膠雞子黃湯合用六黃湯燮理陰陽，調理氣血，獲得滿意效果，此案證治正合「知日之寒溫，月之虛盛，以候氣之浮沉」（《素問·八正神明論》）之旨。
通過上述案例的剖析，更深切認識到五運六氣乃「天地之大紀，人神之通應」，臨床果能「審察病機，無失氣宜」「得時而調之」，就能做到「毋逆天時，是謂至怡」。臨床運用運氣理論時，切切不可膠固，務須隨機達變，因時識宜，庶得古人未發之旨，而能盡其不言之妙。
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