以形態命名：如牛膝，因其莖節粗而膨出，狀似牛的膝關節而得名；白頭翁則以其「近根處有白茸，狀似白頭老翁」而得名；狗脊的根上有金黃色的茸毛，酷似狗脊而得名。
以氣味命名：有酸味的酸棗仁、甜味的甘草、苦味的苦參、辣味的細辛皆以味而得名；五味子因其「皮肉甘酸，核中辛苦，都有鹹味」，五味俱全故而得名；魚腥草因其葉具有魚腥味而得名。
以顏色命名：許多中藥具有天然的顏色。如紅色的有紅花、赤芍、丹參等；黃色的有黃柏、黃連、黃芩等；青色的有青皮、青蒿、大青葉等；白色的有白朮、白芷、白芨等；紫色的有紫草、紫花地丁等。
以產地命名：如川連、川芎、川貝母等，皆因主產於四川而得名；廣藿香、廣皮、廣木香產於廣東；建曲、建澤瀉產於福建；雲茯苓產於雲南；關防風、關黃柏產於東北地區，因而得名。還有蜀椒、杭菊、浙貝、阿膠，皆因產地而得名。
以生長特點命名：如半夏，農曆五月間成熟，恰巧是夏季過一半，故得其名；夏枯草因每到夏至便萎謝而得名；忍冬籐因經冬不凋而得名；萬年青因四季長青而得名；冬蟲夏草因其冬為蟲、夏為草，成蟲體與菌座相連而得名。
以藥物功效命名：防風能治諸風頭痛；澤瀉能洩利水濕；益母草能治婦科病；千年健能「祛風延年」；遠志能益智安神強志；骨碎補能活血壯筋、續骨療傷；孩兒參用於補益兒童氣虛等。
另外，有些中藥的別名也頗耐人尋味。甘草有調和諸藥的功效，尤似和事的國老，故又稱「國老」；大黃瀉下作用猛烈，功大力專，好似勇猛無敵的將軍。故也稱「將軍」；其他如灶心土，稱「伏龍肝」，花生衣稱「鳳凰衣」等，也富有情趣。
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