中醫學是整體醫學而不是局部醫學，是動態醫學而不是靜態醫學，是功能態醫學而不是形態（解剖）醫學，因而有著自身獨特的診治及預防疾病的原理。
中醫診斷疾病的基本原理
診斷就是診察瞭解、分析判斷的過程。醫學診斷是醫生的認知活動過程。不同的醫學診斷活動，有著各自不同的診斷依據、原理和方法。
（一）中醫認識疾病發展的基本理論模型
1、「邪正相爭」——最基本的病變發展演變規律
正常人體，「正氣存內，邪不可干」。病變之時，「邪之所湊，其氣必虛」。正氣是一切抗病因子和因素的總和，邪氣是一切致病因子和因素的概稱。
「邪正相爭」導致出現「邪正盛衰」的變化，隨著這種變化，可出現：正勝邪退，則病癒，或病情漸輕，向愈；邪盛正衰，則病重，或病情漸重，惡化。
2、陰陽失調——常人變為病人的關鍵
正常之人，「陰平陽秘，精神乃治」。病變之時，人的陰陽失衡而出現陰陽盛衰，陽盛則陰病，陰盛則陽病；陽盛則熱，陰盛則寒；陽虛則寒，陰虛則熱。
3、氣機逆亂——病變之人氣機（功能）運行的狀態及其規律
正常人體，氣機的升降出入正常有序，升清降濁，氣血條暢，五臟六腑通泰，四肢百骸得養，內外整體和諧，使得「陰平陽秘」而「正氣存內，邪不可干」。病變之時，氣機的升降出入紊亂甚而逆亂，清者不升、濁者不降，「毒」邪內積；五臟六腑不調，四肢百骸失養，內外整體不和，則病變由生。
（二）中醫診病的基本原理與方法
1、以人體「藏於內，現於外」的「藏象」為依據和信息源
中醫診察瞭解疾病，可以不打開人體，不依賴解剖學知識和現代儀器，僅用望、聞、問、切「四診」，靠醫者的感覺器官，就能從人體外部獲知人體內部變化的信息，進而查知其內部變化。
中醫應用望、聞、問、切方法收集到的信息，就是從整體入手，收集和辨別人「藏於內，現於外」的「藏象」信息。如是，「藏象」就成為中醫診察瞭解、分析疾病的最基本的信息依據和來源。
2、「藏象」是人整體生命活動的具體反應信息
中醫理論認為「藏於內之髒，必有形於外之象」，「有諸內，必形諸外」。因此，通過察外現之「像」，即可知內在之「藏」的變化。其原因和依據在於：
其一，人體以居於內的「五臟」為中心，通過經絡，內連六腑、奇恆之腑，外連經脈、骨肉、皮毛，形成一個互為表裡、如環無端、陰陽互根、氣血流暢、內外互通的有機整體。
其二，人與外界的自然環境、社會環境息息相關，內外互通。人體內外聯繫互動的生命活動過程，也是人體功能活動的過程，產生著大量的信息，發生著交流運動，形成生命活體的「功能態」信息而表現於外，從人體外可征可知。
其三，對「藏於內」而「現於外」的生命活體的「功能態」信息進行辨別分析的方法，蘊含和運用了現代控制論的「黑箱」理論原理。
3、察「像」知「藏」是中醫診病的根本途徑
中醫學對人體的認識不以解剖學的還原分析為主，而是以整體綜合性地收集分析「藏於內、象於外」，「有諸內、必形諸外」的「藏象」為依據。
察外現之「像」而知內在之「藏」，就是通過分辨「藏於內、形於外」的人體「功能態」信息，診病變化。依據分辨「功能態」信息診病，其實質就是應用「生物信息學」原理診病。
4、「以常衡變」是中醫診病的基本標準與參照方式
中醫學認為，萬事萬物均由「陰陽」構成，均有「常」與「變」。天、地、人、事之「常」即為「陰平陽秘」，天、地、人、事之「變」即是「陰陽失衡」，或「陰盛陽衰」，或「陽盛陰衰」，甚則「陰陽離絕」。因此，以「陰平陽秘」所形成之「常」，衡量評價評判「陰陽失衡」所致之「變」，即為中醫診病的基本標準與參照方式。
「常」，即為常規、常理、常識、常量，具有相對性與廣泛性。
「變」，即為變化、改變、異常。細細分辨，又有「常中之變」與「異常之變」的不同。
5、「司外揣內」與「見微知著」是中醫診病的基本方式
中醫根據「有諸內，必形諸外」的藏象依據，通過察「像」知「藏」的根本途徑，依據外在的「像」，綜合分析推知揣測內在之「藏」的生理病理變化。
「司外」，就是緊緊地全面地抓住並分析人體內在之「藏」表現於外的「像」；「揣內」，就是依據外在之「像」，全面分析推知揣測內在之「藏」的狀況。
「見微知著」蘊涵著「生物全息」的原理，揭示和反映出中醫診病整體分析的內在聯繫。中醫認為，整體變化源於局部的變化，局部可顯整體。這蘊涵著「生物全息」的原理。如：全身的氣血、經氣的運行，可在某一些特定局部反映出來。如：脈象、舌象等。
6、整體診察與望、聞、問、切四診合參
在整體觀的指導下，中醫既把握住人的整體聯繫，又注意分部位診察，以全面收集病情資料；既分別運用望、聞、問、切四種診法診察病情，又強調將望、聞、問、切四診的認識合參，印證、校驗其真實性和有效性，以確保診察結論的可靠性和全面性。
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