對於中醫院的發展方向，部分中醫人士心存憂慮：一則擔憂，過快融入現代技術，中醫固有的傳統優勢將特色不保而「西化」，一則懼慮，如與現代社會主流意識脫節，中醫最終將成孤芳自賞的屠龍之技。於是乎，這幾年中醫院在固守傳統還是挺進現代的爭論中徘徊踟躕。筆者認為，應讓「傳統中醫」與「現代中醫」在中醫院裡比翼齊飛，各自根據自己的特點在社會的需求中去求得生存、發展和壯大的空間。
何謂「傳統中醫」和「現代中醫」
在「傳統中醫」和「現代中醫」劃分上，筆者認為，將在西方工業革命產生之前沒有受到其現代理念和技術的影響，或在工業革命產生之後，卻不願接受其現代理念和技術的中醫稱為「傳統中醫」，有人將之稱為「純中醫」。一些學者在界定「傳統中醫」與「現代中醫」時，主要以時間來劃分，即工業革命前為「傳統中醫」，之後為「現代中醫」。這不全面，關鍵要看中醫師本身有無因時應變的意識，有的中醫師有這種意識，卻沒有形成現代中醫的歷史條件，但他們堅決反對墨守成規，比如明代吳又可指出：許多無辜者「不死於病，乃死於醫；不死於醫，乃死於聖經之遺亡也。」清代王清任也認為「今人治之不效者，非今人錯治，乃古方誤人」，明顯地表露出因應時代需求的意識，且都在各自領域為中醫做出了巨大貢獻，雖身處古代，卻備足了現代中醫的精神，他們也就是順理成章的現代中醫了。
「傳統中醫」與「現代中醫」的根本區別在於，前者以中國傳統文化為理論（儒、道、釋）淵藪，以比類取象——氣、陰陽、五行學說為科學方法論，以辨證唯物論為指導思想，以臟腑經絡的生理和病理為基礎，以辨證論治為診療特點，以中國傳統醫學理論與實踐經驗為主體，坐堂醫是其外化形象。而後者則是在「傳統中醫」的基礎上廣泛吸納各個時期有用的現代理念、技術與方法為我所用，中醫院是其外化形象。在研究方法上，前者以「人文哲學科學」為主，後者更吸納了「自然工科科學」養分，這也從根本上導致了二者的不「兼容」，「傳統中醫」與「現代中醫」的碰撞也因此從未消停過，「傳統」指責「現代」數典忘祖，「現代」批評 「傳統」夜郎自大，在相互「掐架」的過程，受傷最大的就是中醫。因此，與其「同室操戈，互相貶損」，不若「比翼齊飛，各揚所長」。
「傳統」與「現代」齊飛，讓中醫院擺脫純中醫匱乏的尷尬
從邏輯上講，既然是中醫院，其內涵架構就應包括中醫「傳統」和「現代」的全部。而現行中醫院的架構設置全部沿用的是西醫醫院模式，這就導致一些中醫院只有一塊「姓中」的牌子上，內裡根本就「不是中」，病人到中醫院沒有中醫的氛圍，青年中醫分配到中醫院裡沒有歸屬感，中醫的文化根脈得不到有效傳承。另一方面，如果中醫院全部停留在「傳統中醫」的方法和技術上，中醫就只能躺在老祖宗的功勞薄上停步不前，而祖宗們未曾見過的一些急、難、危、重疾病，後輩中醫們就會因此得不到探索的機會，新傷病如重大傳染病、災害性損傷、車禍傷等，也會因傳統中醫的局限性得不到臨床實踐，中醫就會失去發展的新源泉。
因此，中醫院首先應從架構上實現「傳統中醫」和「現代中醫」並舉齊飛，建立起有中醫院自身體系特點的架構模式，充分體現中醫院自身的管理特點，其基本思路是：把中醫院的內涵架構分設為「傳統中醫部」、「現代中醫部」兩個大板塊。
傳統中醫部，完全按傳統中醫的自身學術規律來處理臨床事務的場所。為了保持中醫固有的傳統風貌，遵循其自身的學術規律，滿足社會上對「純中醫」的需求，為傳統中醫從業人員營造出「繼承為先，經典為本，古法至上，防治皆『中』」的氛圍，傳統醫學部內涵配置，除不得借助和運用現代西方醫學的方法和技術外，所有傳統中醫的理論、技術、方法、工具、方藥等都應該允許存在，並根據病人需求用諸臨床。
現代中醫部，是在中醫理論指導下廣泛吸納現代科學技術成果為其所用的場所。它可以借助現代設備從事中醫的診斷，可以用計算機技術為病人辨證論治，為青年中醫師提供老中醫專家智庫，可以利用現代給藥方式，為中藥開闢新的給藥途徑等，其基本框架有如現今各地的中醫院。之所以說是「基本框架」，而不說「內涵配置」，是因為現行模式下的中醫院的內涵配置裡最缺乏的就是「傳統（純）中醫」，這也是傳統中醫人士誚噪中醫院被「西化」的把柄。而中醫院內設置傳統中醫部，能從根本上改變中醫院只「姓中」而「不是中」 的尷尬。
傳統中醫部與現代中醫部的內涵關係
內涵關係，是指在中醫院內部，「傳統中醫部」與「現代中醫部」的協調與配合。
在科室設置上，傳統中醫部可以根據《周禮》、《諸病源候論》、《醫宗醫鑒》等典籍的描述來設置具有傳統中醫學術特點的基本科室，如時病科（包括傷寒、溫病等，相當於現代的感冒等），癰瘍科（包括癰、疽、疔、癤、皮膚病、內癰如腸癰、肺癰，附骨疽等，相當於現代的外科、皮膚科和急腹症），稚病科（小兒病等，相當於現代的兒科），女科（包括婦病、產病等，相當於現代的婦產科），雜病科（所有內傷病患等，相當於現代的內科）、神病科（包括驚、癇、狂、失眠等，相當於現代的精神科或神經內科）。除一些基本科室，由於中醫強調「三因制宜」，各地可根據實際情況設置能體現本地地緣和病譜特色的中醫科室。
現代中醫部主要用現代醫學分科的方法來設置科室，這主要是因為：１生活在現代社會的人們，已經很難將一些傳統中醫病證和現代所指稱的病症對應起來，比如傳統醫學所稱的「郁證」、「髒躁」等；２一些沒有記載的後傳統中醫時期的新病症，如禽流感、艾滋病、乙肝、非典等，人們只能用現代眼光和思維去考量它；３ 現代科技帶動的「四診」及其治療技術科室是中醫診療技術的現代延伸，比如醫技科室、影像功能科室、核醫學科室、ICU室等。這些只是按現代醫學分科的理由，並不是說現代中醫部完全與中醫「絕緣」。相反的是，在借助現代科技手段和方法的同時，現代中醫部必須依據中醫理論和方法來處理臨床事務，取得中醫執業資格的現代中醫部人員，可以運用中醫理論和方法來對現代醫學進行匹配性探索。即使是像醫技科室這類現代味很濃的科室，現代中醫部也有責任運用中醫的方法對其進行挖掘、整理、總結，使之真正上升為中醫理論。
傳統中醫部的主要責任之一是繼承中醫，現代中醫部的主要職責之一是發揚中醫。「繼承」是以原汁原味為主，「發揚」是由粗至精，有揚有棄，這也可看作是傳統中醫部與現代中醫部在職責上的根本區別。基於這一區別，傳統中醫和現代中醫都應有嚴格的准入制度，各自按其職責和特點相對獨立地開展工作。特別是傳統中醫部相對獨立地開展臨床工作，可以減少現代因素的干擾，能使其更好地保持傳統中醫應有的特色。那麼，靠什麼來使「傳統」和「現代」這兩個醫學部在相對獨立的情況下互動起來呢？就是現代醫療的會診制度。傳統（現代）醫學部接診的病人，如果需要在現代（傳統）中醫部進一步診治，可以申請醫務部門組織相關人員會診，確定相應的治療方案，其好處在於：１能有效地解決二者需要相互配合處理的臨床事務；２現代中醫能成為傳統中醫的備急手段，從而有效支援傳統中醫對「十八反」、「十九畏」之類學術禁區進行有益探索；３傳統中醫能有效克服現代中醫從根源上解決問題的不足；４有效地整合二者的功能，而不丟失各自的特色。
總之，中醫院內涵架構上設置「傳統中醫部」和「現代中醫部」，能很好地理順中醫繼承和發展的矛盾關係，既可以使其獨立自主地發揮各自的優勢，又能融合二者的特長產生出整合效應，從根本上擺脫中醫院無「（純）中醫」的尷尬。目前公立醫院改革已全面展開，是中醫院內涵體系架構優化的最佳契機，只要發揮中醫人的群體智慧，就一定能實現「傳統中醫」與「現代中醫」在中醫院裡比翼齊飛。而在「傳統中醫」與「現代中醫」的相互滲透下，中醫院必將迎來新的輝煌。
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