通常認為，小柴胡湯治療寒熱往來而咳嗽者。近代醫家唐容川著《血證論》，稱和法為「血證之第一良法」，在血證的治療中廣用小柴胡湯。
《血證論·咳嗽》：「《內經》云：五臟六腑皆有咳嗽，而無不聚於胃關於肺，上條分肺胃治已詳。茲有一方，可以統治肺胃者，則莫如小柴胡湯。肺火盛加麥冬；心火盛加黃連、當歸；肝火盛加當歸、胡黃連；黃昏咳嗽為火浮於肺，加五倍子、五味子以斂之；五更咳嗽，為食積之火，至寅時流入肺經，加萊菔子；痰凝氣滯者，加瓜蔞霜、旋覆花、杏仁、桔梗、射干、川貝母；水飲上衝者，加葶藶子、桑白皮、細辛、五味子；有寒加乾薑、雲茯苓；若兼外感，發熱惡寒，鼻塞頭痛而咳嗽者，宜小柴胡湯加荊芥、紫蘇、杏仁、薄荷。蓋小柴胡能通水津，散鬱火，升清降濁，左宜右有，加減合法，則曲盡其妙。」
本段論述是基於「虛勞失血之咳嗽」，著眼於通水津、散鬱火、升清降濁，可謂深識小柴胡湯者。
那麼，由於水津不布、夾有鬱火所致之咳嗽，就可以考慮用小柴胡湯加減治療。倘若沒有明顯正虛，小柴胡湯中溫補之品可少用或不用。
清代醫家陳修園在《醫學實在易》中指出：「余臨證以來，每見咳嗽百藥不效者，迸去雜書之條緒紛繁，而覓出一條生路，止於《傷寒論》得之治法。《傷寒論》云：『上焦得通，津液得下，胃氣因和』三句，是金針之度……《傷寒論》小柴胡湯謂：『咳者去人參、生薑，加乾薑、五味子。』此為傷寒言，而不盡為傷寒言也。余取『上焦得通』三句，借治勞傷咳嗽，往往獲效。」
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